Vetenskapliga data (December 2019)

Montering av ett tidigt moget japonica (Geng) risgenom, Suijing18, baserat på PacBio och Illumina-sekvensering

Montering av ett tidigt moget japonica (Geng) risgenom, Suijing18, baserat på PacBio och Illumina-sekvensering

ämnen Växtuppfödning Strukturell variation Abstrakt Den tidiga mognade rissorten Japonica ( Geng ), Suijing18 (SJ18), har flera elitdrag inklusive hållbar sprängmotstånd, god kornkvalitet och högt utbyte. Med hjälp av PacBio SMRT-teknik producerade vi över 25 Gb långlästa sekvenseringsrådsdata från SJ18 med en täckning på 62 ×. Genom att anvä

Digital höjdmodell och ortofotografier av Grönland baserat på flygfotografier 1978–1987

Digital höjdmodell och ortofotografier av Grönland baserat på flygfotografier 1978–1987

ämnen Klimat- och jordsystemmodellering Cryospheric science Geomorfologi Abstrakt Digitala höjdmodeller (DEM) spelar en framträdande roll i glaciologiska studier för massbalansen hos glaciärer och isark. Genom att tillhandahålla en tidsbild av glaciärgeometri är DEM avgörande för de flesta glacierutvecklingsmodelleringsstudier, men är också viktiga för kryosfärisk modellering i allmänhet. Vi presentera

En omfattande databas med kvalitetsgraderade fossila åldrar för Sahuls kvartära ryggradsdjur

En omfattande databas med kvalitetsgraderade fossila åldrar för Sahuls kvartära ryggradsdjur

ämnen Ekologisk modellering paleoekologi Paleontologi Abstrakt Studien av paleo-kronologier med fossila data ger bevis för tidigare ekologiska och evolutionära processer och är därför användbar för att förutsäga mönster och effekter av framtida miljöförändringar. Men robustheten för slutsatser gjorda från fossila åldrar förlitar sig starkt på både mängden och kvaliteten på tillgängliga data. Vi sammanställde kvar

RiceAtlas, en rumslig databas över globala riskalendrar och produktion

RiceAtlas, en rumslig databas över globala riskalendrar och produktion

ämnen Lantbruk Geografi Abstrakt Att veta var, när och hur mycket ris som planteras och skördas är avgörande information för att förstå effekterna av politik, handel och global och teknisk förändring på livsmedelssäkerheten. Vi utvecklade RiceAtlas, en rumslig databas om säsongsfördelningen av världens risproduktion. Den består av

Regionalskalahanteringskartor för skogsområden i sydöstra USA och USA: s nordöstra Stillahavsområdet

Regionalskalahanteringskartor för skogsområden i sydöstra USA och USA: s nordöstra Stillahavsområdet

ämnen Påverkan på miljön Skogsekologi Abstrakt Skogar i USA förvaltas av flera offentliga och privata enheter som gör harmonisering av tillgängliga data och efterföljande kartläggning av förvaltningen utmanande. Vi kartlade fyra viktiga typer av skogsförvaltning, produktion, ekologisk, passiv och bevarande, med 250 meter rumslig upplösning i Sydöstra USA (SEUS) och Pacific Northwest (PNW) USA. Både ekolog

Se-SAD seriella femtosekundkristallografidatabaser från selenobiotinyl-streptavidin

Se-SAD seriella femtosekundkristallografidatabaser från selenobiotinyl-streptavidin

ämnen Biologisk fysik Imaging Makromolekyler och kluster Nanocrystallography Abstrakt Vi tillhandahåller en detaljerad beskrivning av selenobiotinyl-streptavidin (Se-B SA) samkristalldatasätt inspelade med hjälp av Coherent X-ray Imaging (CXI) -instrumentet vid Linac Coherent Light Source (LCLS) för selen enkelvåglängd anomal diffraktion (Se- SAD) strukturbestämning. Se-B S

Förbättra studier av connectome i autism med hjälp av datautbyte II av autism hjärnan avbildning II

Förbättra studier av connectome i autism med hjälp av datautbyte II av autism hjärnan avbildning II

ämnen Autismspektrum störningar Hjärnavbildning Funktionell magnetisk resonansavbildning Magnetisk resonansavbildning neuro~~POS=TRUNC Abstrakt Den andra iterationen av Autism Brain Imaging Data Exchange (ABIDE II) syftar till att förbättra omfattningen av forskning om hjärnans kontaktomik inom Autism Spectrum Disorder (ASD). I öv

Individuell hjärnkartläggning, ett högupplöst fMRI-datasätt för kognitiv kartläggning

Individuell hjärnkartläggning, ett högupplöst fMRI-datasätt för kognitiv kartläggning

ämnen Uppmärksamhet Kognitiv kontroll Beslut Språk Magnetisk resonansavbildning Abstrakt Funktionell magnetisk resonansavbildning (fMRI) har främjat hjärnkartläggning på perceptuella, motoriska samt kognitiva funktioner på högre nivå. Hittills har emellertid ingen datainsamling systematiskt tagit itu med den funktionella kartläggningen av kognitiva mekanismer i en fin rumslig skala. IBC-proje

RNAi-skärmar för Rho GTPase-regulatorer för cellform och YAP / TAZ-lokalisering vid trippel negativ bröstcancer

RNAi-skärmar för Rho GTPase-regulatorer för cellform och YAP / TAZ-lokalisering vid trippel negativ bröstcancer

ämnen Bröstcancer Mobilavbildning Screening med hög kapacitet RHO signalering RNAi Abstrakt För att metastasera måste trippelnegativ bröstcancer (TNBC) göra dynamiska förändringar i cellform. Formen på alla eukaryota celler regleras av Rho Guanine Nucleotide Exchange Factors (RhoGEF), som aktiverar Rho-familjens GTPaser som svar på mekaniska och informativa ledtrådar. Däremot hä

En högupplösta probabilistiska in vivo-atlas av humana subkortikala hjärnkärnor

En högupplösta probabilistiska in vivo-atlas av humana subkortikala hjärnkärnor

ämnen Hjärna Beslut Magnetisk resonansavbildning Motivering Pris Abstrakt De senaste framstegen inom metoder för avbildning av magnetisk resonans, inklusive datainsamling, förbehandling och analys, har gynnat forskning om subkortikala hjärnkärnors bidrag till mänsklig kognition och beteende. Samtidigt har denna utveckling lett till ett ökande behov av en högupplöst probabilistisk in vivo anatomisk atlas av subkortikala kärnor. För att m

ANI-1, En datamängd med 20 miljoner beräknade konformationer utanför jämvikt för organiska molekyler

ANI-1, En datamängd med 20 miljoner beräknade konformationer utanför jämvikt för organiska molekyler

ämnen Kombinatoriska bibliotek Beräkningskemi Funktionsteori för densitet Metodutveckling Abstrakt En av de stora utmaningarna i modern teoretisk kemi är att utforma och implementera tillnärmningar som påskyndar ab initio- metoder utan förlust av noggrannhet. Maskininlärningsmetoder framträder som ett kraftfullt tillvägagångssätt för att konstruera olika former av överförbara atomistiska potentialer. De har framgå

Ensemble av europeiska regionala klimatsimuleringar för vintern 2013 och 2014 från HadAM3P-RM3P

Ensemble av europeiska regionala klimatsimuleringar för vintern 2013 och 2014 från HadAM3P-RM3P

ämnen Erkännande Påverkan på miljön Abstrakt Stora datamängder som används för att studera påverkan av antropogen klimatförändring på översvämningarna 2013/14 i Storbritannien tillhandahålls. Uppgifterna består av störda initiala förhållandssimuleringar med hjälp av den territoriella klimatmodelleringsramen. Två olika basförhå

En databas över metazoan cytokrom c oxidas-subenhet I-gensekvenser härrörande från GenBank med CO-ARBitrator

En databas över metazoan cytokrom c oxidas-subenhet I-gensekvenser härrörande från GenBank med CO-ARBitrator

ämnen Biologisk mångfald Klassificering och taxonomi Data mining Mitokondrialt genom Abstrakt Cytochrome C Oxidas-subenhet I-genen (”COI”) är de facto- standard för DNA-streckkodning. Organismidentifiering baserad på COI kräver en noggrann och omfattande kommenterad databas med COI-sekvenser. En sådan

En samling av australiska Drosophila-uppsättningar om klimatanpassning och artsfördelning

En samling av australiska Drosophila-uppsättningar om klimatanpassning och artsfördelning

ämnen Klimatförändringsekologi Evolutionär biologi Evolutionsgenetik Experimentell evolution Befolkningsgenetik Abstrakt Den australiska Drosophila Ecology and Evolution Resource (ADEER) samlar australiska datasätt om drosofilidflugor, som syftar till att undersöka frågor kring klimatanpassning, artsfördelningsgränser och populationsgenetik. Austral

Ett datasats med flera årtionden av månatliga undersökningar av strandprofiler och landvågstvingning i Narrabeen, Australien

Ett datasats med flera årtionden av månatliga undersökningar av strandprofiler och landvågstvingning i Narrabeen, Australien

ämnen Civilingenjör Geomorfologi Fysisk oceanografi Abstrakt Långsiktiga observationsdatasätt som registrerar och kvantifierar variation, förändringar och trender i strandmorfologi vid sandkusten tillsammans med det tillhörande vågklimatet är sällsynta. Ett månadsprogram för strandprofilundersökningar som inleddes i april 1976 vid Narrabeen, beläget på Sydneys norra stränder i sydöstra Australien, är en av bara en handfull platser över hela världen där pågående och oavbruten strandövervakning nu sträcker sig över flera decennier. När Narrabeen-undersökni

Vattenkvalitetsmätningar i San Francisco Bay av US Geological Survey, 1969–2015

Vattenkvalitetsmätningar i San Francisco Bay av US Geological Survey, 1969–2015

ämnen Ekosystemets ekologi Miljöövervakning Marin kemi Abstrakt US Geological Survey (USGS) upprätthåller ett platsbaserat forskningsprogram i San Francisco Bay (USA) som började 1969 och fortsätter och tillhandahåller en av de längsta uppgifterna om vattenkvalitetsmätningar i en nordamerikansk flodmynning. Bestånds

Encellig RNA-sekvensering av testade vuxna mus

Encellig RNA-sekvensering av testade vuxna mus

ämnen Genexpression Mus Nästa generations sekvensering spermatogenes Abstrakt Spermatogenesis är ett effektivt och komplext system för kontinuerlig celldifferentiering. Tidigare studier som undersökte transkriptomerna från olika cellpopulationer i testiklarna förlitade sig antingen på sorteringsceller, cellutarmning eller juvenila djur där inte alla stadier av spermatogenes har avslutats. Vi pres

SCSPOD14, ett fysiskt oceanografiskt datasystem från Sydkinesiska havet härrörande från in situ-mätningar under 1919–2014

SCSPOD14, ett fysiskt oceanografiskt datasystem från Sydkinesiska havet härrörande från in situ-mätningar under 1919–2014

ämnen Hydrologi Fysisk oceanografi Abstrakt Förutom de oceanografiska data som finns tillgängliga för Sydkinesiska havet (SCS) från World Ocean Database (WOD) och Array for Realtime Geostrophic Oceanography (Argo), har en svit observationer gjorts av South China Sea Institute of Oceanologi (SCSIO) från 1970-talet. Här

En databas för övervakning av termiska avvikelser över Amazonasskogen och intilliggande intertropiska hav

En databas för övervakning av termiska avvikelser över Amazonasskogen och intilliggande intertropiska hav

ämnen Klimatförändringar påverkar Skogsekologi Tropisk ekologi Abstrakt Framsteg inom informationsteknologi och tillgänglighet till klimat- och satellitdata under senare år har gynnat utvecklingen av webbaserade verktyg med användarvänliga gränssnitt för att underlätta spridningen av geo / biofysiska produkter. Dessa pro

HYSOGs250m, globala gridade hydrologiska markgrupper för kurvnummerbaserad avrinningsmodellering

HYSOGs250m, globala gridade hydrologiska markgrupper för kurvnummerbaserad avrinningsmodellering

ämnen Påverkan på miljön Hydrologi En författarkorrigering till denna artikel publicerades den 26 februari 2019 Abstrakt Hydrologiska markgrupper (HSG) är en grundläggande komponent i metoden USDA curve-number (CN) för uppskattning av regnnedströmning; ändå är dessa data inte lätt tillgängliga i ett format eller rumsupplösning som är lämplig för regionala och globala modelleringsapplikationer. Vi utvecklade et