Journalen farmakogenomik (April 2020)

Hjärnuttrycket av gener involverade i inflammatoriskt svar, ribosomen och inlärning och minne förändras av centralt injicerad lipopolysackarid i möss

Hjärnuttrycket av gener involverade i inflammatoriskt svar, ribosomen och inlärning och minne förändras av centralt injicerad lipopolysackarid i möss

Abstrakt Neuroinflammation spelar en roll i utvecklingen av flera neurodegenerativa störningar. Vi använde en lipopolysackarid (LPS) -modell för neuroinflammation för att karakterisera genuttrycksförändringarna som ligger bakom de inflammatoriska och beteendeeffekterna av neuroinflammation. En enda intracerebroventrikulär injektion av LPS (5 μg) administrerades i den laterala ventrikeln av möss, och 24 timmar senare undersökte vi genuttryck i hjärnbarken och hippocampus med hjälp av mikroarray-teknik. Gene Ontol

Föreningen av cytokrom P450-genetiska polymorfismer med sulfolanbildning och effekten av ett busulfan-baserat konditioneringssystem hos pediatriska patienter som genomgår hematopoietisk stamcellstransplantation

Föreningen av cytokrom P450-genetiska polymorfismer med sulfolanbildning och effekten av ett busulfan-baserat konditioneringssystem hos pediatriska patienter som genomgår hematopoietisk stamcellstransplantation

ämnen Celltransplantation Sjukdomgenetik Pediatrik Farma Abstrakt Cytokrom P450-enzymer (CYP) och flavininnehållande monooxygenaser (FMO) har troligen en roll i oxidationen av mellanliggande metaboliter av busulfan (Bu). In vitro- studier för att undersöka involveringen av dessa enzymer är besvärliga på grund av den flyktiga naturen hos den mellanliggande metaboliten tetrahydrotiofen (THT) och bristen på känsliga kvantifieringsmetoder. Denna s

Tiklopidininducerad hepatotoxicitet är associerad med specifika humana leukocytantigengenomiska subtyper hos japanska patienter: en preliminär fall-kontrollstudie

Tiklopidininducerad hepatotoxicitet är associerad med specifika humana leukocytantigengenomiska subtyper hos japanska patienter: en preliminär fall-kontrollstudie

Abstrakt Genetiska riskfaktorer för tiklopidininducerad hepatotoxicitet bestämdes hos 22 japanska patienter med tiklopidininducerad hepatotoxicitet och 85 japanska patienter som tolererade tiklopidinbehandling utan att ha haft biverkningar. Det fanns en signifikant korrelation mellan tiklopidininducerad hepatotoxicitet och fem humana leukocytantigen (HLA) alleler: HLA-A * 3303, HLA-B * 4403, HLA-Cw * 1403, HLA-DRB1 * 1302 och HLA-DQB1 * 0604 ( korrigerad sannolikhet ( P ) -värde ( Pc ) <0, 01). I

Multietnisk distribution av kliniskt relevanta CYP2C-genotyper och haplotyper

Multietnisk distribution av kliniskt relevanta CYP2C-genotyper och haplotyper

ämnen haplotyper farmakogenomik Befolkningsgenetik Abstrakt För att bestämma CYP2C19- och CYP2C8- allelfrekvenser genotypades 28 kodande och / eller funktionella varianter hos 1250 afroamerikanska, asiatiska, kaukasiska, latinamerikanska och Ashkenazi judiska (AJ) individer. De kombinerade CYP2C19- allelfrekvenserna varierade från ∼ 0, 30 till 0, 41; CYP2C8- frekvenserna var dock mycket lägre (∼ 0, 04–0, 13). Efter inf

Genuttryck i blod är associerat med risperidonrespons hos barn med autismspektrumstörningar

Genuttryck i blod är associerat med risperidonrespons hos barn med autismspektrumstörningar

ämnen Drogterapi Genexpression Pediatrik Abstrakt Barn med autismspektrumsjukdomar (ASD) har ofta allvarliga beteendeproblem. Inte alla barn med dessa problem svarar på atypiska antipsykotiska läkemedel; därför undersökte vi om perifert blodgenuttryck före behandling med risperidon, en atypisk antipsykotisk, var förknippad med förbättringar i allvarliga beteendestörningar 8 veckor efter risperidonbehandling hos 42 ASD-personer (ålder 112, 7 ± 51, 2 månader). Exonuttrycks

Allelspecifikt uttryck och genmetylering vid kontroll av CYP1A2-mRNA-nivå i mänskliga lever

Allelspecifikt uttryck och genmetylering vid kontroll av CYP1A2-mRNA-nivå i mänskliga lever

Abstrakt Grunden för interindividuell variation i CYP1A2- genuttrycket förstås inte helt och de kända genetiska polymorfismerna i genen ger ingen förklaring. Vi undersökte om CYP1A2- genuttrycket regleras av DNA-metylering och visar allelspecifikt uttryck (ASE) med 65 humana lever. Fyrtioåtta procent av levern visade ASE som inte är associerade med CYP1A2- mRNA-nivåerna. Omfattn

Undersökning av interindividuell variation av en-kolfolatväg: en bioinformatisk och genetisk översikt

Undersökning av interindividuell variation av en-kolfolatväg: en bioinformatisk och genetisk översikt

Abstrakt Genetiska polymorfismer i foliumvägen med en kol har studerats i stor utsträckning i samband med ett antal tillstånd. Merparten av forskningen har fokuserat på 677C > T- polymorfismen i den kodande regionen för 5, 10-metylentetrahydrofolatreduktasgenen (MTHFR). Det finns emellertid totalt 25 gener i denna väg som kodar för enzymer, transportörer och receptorer, som kan undersökas med 267 märkning av enstaka nukleotidpolymorfismer (SNP); med användning av SNP-databas (dbSNP), finns 38 icke-synonyma SNP: er med en mindre allelfrekvens> 5% i dessa gener. De flesta

Differentialeffekt av rs4149056-varianten i SLCO1B1 på myopati förknippad med simvastatin och atorvastatin

Differentialeffekt av rs4149056-varianten i SLCO1B1 på myopati förknippad med simvastatin och atorvastatin

Abstrakt Statiner minskar hjärt-morbiditet och mortalitet hos lämpligt utvalda patienter. Statinassocierad myopati är dock en betydande risk förknippad med dessa medel. Nyligen rapporterades variation i SLCO1B1- genen för att förutsäga simvastatin-associerad myopati. Syftet med denna studie var att replikera associering av rs4149056-varianten i SLCO1B1 med svår statinassocierad myopati i en kohort av patienter som använde olika statinläkemedel och att undersöka sambandet med specifika statintyper. Vi identi

DRD2 TaqI-B-polymorfism och dess förhållande till rökning avhållsamhet och abstinenssymptom

DRD2 TaqI-B-polymorfism och dess förhållande till rökning avhållsamhet och abstinenssymptom

Abstrakt Dopaminreceptor D2 ( DRD2 ) -genen har polymorfismer som har kopplats till reglering av dopaminsystemet och till en ökad förekomst av rökning. Den aktuella studien undersökte förhållandet mellan DRD2 Taq I-A och -B polymorfismerna med korttids kliniskt resultat (abstinens och abstinenssymptom), insamlade från dagliga (14 pre-quit och 42 post-quit) dagbardata bland rökare ( n = 116 ) behandlas med nikotinplåstret plus antingen venlafaxin eller placebo. Resulta

Undersökande aspirinresistensstudie hos friska japanska frivilliga (J-ART) med användning av blodplättaggregering som ett mått på trombogenicitet

Undersökande aspirinresistensstudie hos friska japanska frivilliga (J-ART) med användning av blodplättaggregering som ett mått på trombogenicitet

Abstrakt Aspirin förhindrar framställning av tromboxan A2 (TXA2) genom irreversibelt hämning av blodplättcyklooxygenas, uppvisande antiplodtag-verkningar. Detta medel har rapporterats förhindra återfall hos patienter med ischemisk hjärtsjukdom eller hjärninfarkt via denna verkningsmekanism. Det finns emellertid individuella skillnader i denna åtgärd, och aspirin är inte effektivt hos vissa patienter, som kallas 'aspirinresistens'. I denna s

PGMD: en omfattande manuellt kurerad farmakogenomisk databas

PGMD: en omfattande manuellt kurerad farmakogenomisk databas

ämnen Beräkningsbiologi och bioinformatik Abstrakt PharmacoGenomic Mutation Database (PGMD) är en omfattande manuellt kurerad farmakogenomisk databas. Två huvudkällor för PGMD-uppgifter är peer-review litteratur och Food and Drug Administration (FDA) och European Medicines Agency (EMA) läkemedelsetiketter. PGMD-k

Omfattande genomomfattande utvärdering av lapatinib-inducerad leverskada ger en enda genetisk signal centrerad på känd riskallel HLA-DRB1 * 07: 01

Omfattande genomomfattande utvärdering av lapatinib-inducerad leverskada ger en enda genetisk signal centrerad på känd riskallel HLA-DRB1 * 07: 01

ämnen Genetisk föreningsstudie Abstrakt Lapatinib är förknippat med en låg förekomst av allvarlig leverskada. Tidigare undersökningar har identifierat och bekräftat klass II-allelen HLA-DRB1 * 07:01 att vara starkt associerad med lapatinib-inducerad leverskada; emellertid begränsar det måttliga positiva prediktiva värdet dess kliniska användbarhet. För att be

Koordinerad dysregulation av mRNA och mikroRNA i råttens mediala prefrontala cortex efter en historia av alkoholberoende

Koordinerad dysregulation av mRNA och mikroRNA i råttens mediala prefrontala cortex efter en historia av alkoholberoende

ämnen Genetik i nervsystemet miRNA Prefrontal cortex Abstrakt Långtidsförändringar i hjärngenuttryck har identifierats i alkoholberoende, men underliggande mekanismer är fortfarande okända. Här undersökte vi den potentiella rollen för mikroRNA (miRNA) för ihållande förändringar av genuttryck i råttens mediala prefrontala cortex (mPFC) efter en historia av alkoholberoende. Tvåflaskors f

Distribution av genetiska polymorfismer associerade med hepatit C-virus (HCV) antiviralt svar i en multietnisk och blandad population

Distribution av genetiska polymorfismer associerade med hepatit C-virus (HCV) antiviralt svar i en multietnisk och blandad population

ämnen Genetisk variation Hepatit C Farma Abstrakt Förekomsten av genetiska polymorfismer identifierade som prediktorer för terapeutiskt inducerat hepatit C-virus (HCV) clearance skiljer sig åt mellan etniska grupper. Det finns emellertid ett brist på information om deras förekomst i sydamerikanska populationer, vars genetiska bakgrund är mycket blandad. Följa

Polymorfismer i SLC6A4- och HTR2A-generna påverkar behandlingsresultatet efter antidepressiva terapi

Polymorfismer i SLC6A4- och HTR2A-generna påverkar behandlingsresultatet efter antidepressiva terapi

Abstrakt Majoriteten av antidepressiva läkemedel verkar genom att öka synaptiska serotoninnivåer i hjärnan. Genetisk variation i serotoninrelaterade gener kan därför påverka antidepressiva effekt. I denna studie analyserades nio polymorfismer i fyra serotoninreceptorgener (HTR1B, HTR2A, HTR5A och HTR6) och serotonintransportgenen (SLC6A4) för att undersöka deras inflytande på antidepressivt svar i en välkarakteriserad unipolär depressiv population ( n = 166) efter en protokolliserad behandlingsregim. 5-HTTLPR-k

Jag har glömt att jag någonsin har genomgått hjärtkirurgi ...

Jag har glömt att jag någonsin har genomgått hjärtkirurgi ...

Tråkigt är det, trots stroke och andra stora komplikationer, lindriga neuro-psykiatriska störningar uppstår ofta efter kirurgiska ingrepp. Post-operativ kognitiv nedgång (POCD) anses vara ett tillfälligt tillstånd, och det kan förknippas med tekniskt alla typer av operationer, oavsett varaktighet, "svårighetsgrad" eller andra kirurgiska variabler. 1 POCD

Förening av en karboxylesteras 1-polymorfism med aptitreducering hos barn och ungdomar med uppmärksamhetsunderskott / hyperaktivitetsstörning behandlad med metylfenidat

Förening av en karboxylesteras 1-polymorfism med aptitreducering hos barn och ungdomar med uppmärksamhetsunderskott / hyperaktivitetsstörning behandlad med metylfenidat

ämnen ADHD Pediatrik Farma Abstrakt Karboxylesteras 1 är det enzym som är involverat i metylfenidatmetabolism. Syftet med denna studie var att utvärdera sambandet mellan en −75 T> G-polymorfism och aptitreducering hos barn med ADHD (ADHD). Ett prov av 213 barn med ADHD undersöktes. Det primära utfallet var aptitreduktion mätt med Barkley Stimulant Side Effect Rating Scale applicerad vid baslinjen, efter 1 och 3 månaders behandling. MPH-dose

Identifiering av gener som ger tumörcellresistens till Aurora B-kinasinhibitorn, AZD1152

Identifiering av gener som ger tumörcellresistens till Aurora B-kinasinhibitorn, AZD1152

Abstrakt AZD1152 är en mycket selektiv Aurora B-kinasinhibitor som för närvarande genomgår fas I och II klinisk utvärdering hos patienter med akut myelogen leukemi och avancerade fasta maligniteter. Vi har etablerat två AZD1152-resistenta cellinjer från SW620 kolon- och MiaPaCa-bukspottkörtelkarcinomlinjer, som är> 100-faldiga resistenta mot den aktiva metabolitten av AZD1152, AZD1152 HQPA och intressant, korsresistenta mot pan-Aurora-kinasinhibitorn, VX- 680 / MK0457. Med hjä

Roll av polymorf mannlig CYP2B6 vid bioaktivering av cyklofosfamid

Roll av polymorf mannlig CYP2B6 vid bioaktivering av cyklofosfamid

Abstrakt Rollen för polymorf CYP2B6 i cyklofosfamid (CPA) bioaktivering undersöktes i mänskliga levermikrosomer. Totalt 67 humana leverprover genotypades först med avseende på CYP2B6 * 5 och CYP2B6 * 6-alleler med variant. CYP2B6-apoproteinnivåer i 55 levermikrosomala beredningar bedömdes genom immunblotting. 4-Hyd

Polymorfism i multidrug-resistensassocierad proteingen 3 är associerad med resultat vid akut lymfoblastisk leukemi hos barn

Polymorfism i multidrug-resistensassocierad proteingen 3 är associerad med resultat vid akut lymfoblastisk leukemi hos barn

ämnen Akut lymfocytisk leukemi Farma Abstrakt Multidrug-resistensrelaterade proteiner (MRP) 2, 3 och 5 är involverade i utflödet av läkemedel som används vid akut lymfoblastisk leukemi (ALL) -behandling. Polymorfismer av dessa gener undersöktes med avseende på en förening med behandlingssvar hos 273 barn ALLA patienter. MRP3 A

En sällsynt förlust av funktion SCN5A-variant är associerad med lidokaininducerad ventrikelflimmer

En sällsynt förlust av funktion SCN5A-variant är associerad med lidokaininducerad ventrikelflimmer

ämnen arytmier Farma Sällsynta varianter Abstrakt Det mänskliga genomet innehåller över 4 miljoner varianter, jämfört med referensgenomet, inklusive sällsynta sekvensvarianter, som har potential att utöva stora fenotypiska effekter, såsom mottaglighet för läkemedeltoxicitet. Vi rapporterar identifiering och funktionell karaktärisering av en sällsynt icke-synonym (p.A1427S) -vari

Genetisk mångfald och funktion i cytosoliska sulfotransferaser hos människa

Genetisk mångfald och funktion i cytosoliska sulfotransferaser hos människa

Abstrakt Aminosyrasubstitutioner, som är resultatet av vanliga nonsynonyma (NS) polymorfismer, kan dramatiskt förändra funktionen hos det kodade proteinet. Att få insikt i hur dessa ersättningar ändrar funktion är ett steg mot att förvärva förutsägbarhet. I denna studie införlivade vi genutjämning, funktionell genomik, aminosyrakarakterisering och kristallstrukturanalys för de cytosoliska sulfotransferaserna (SULT) för att försöka få förutsägbarhet beträffande funktionen av variantallozzymer. Tidigare åtskiljade

Alkoholism och alkoholkonsumtionsdryck förutsäges av alkohol dehydrogenas gener

Alkoholism och alkoholkonsumtionsdryck förutsäges av alkohol dehydrogenas gener

Abstrakt Alkoholdryckvanor och alkoholism är delvis genetiskt bestämda. Alkohol degraderas främst av alkoholdehydrogenas (ADH) varvid genetisk variation som påverkar hastigheten för nedbrytning av alkohol finns i ADH1B och ADH1C . Det är biologiskt troligt att dessa variationer kan vara förknippade med alkoholdryckvanor och alkoholism. Genom

Serotonintoxicitet från antidepressiva överdoser och dess associering med T102C-polymorfismen hos 5-HT2A-receptorn

Serotonintoxicitet från antidepressiva överdoser och dess associering med T102C-polymorfismen hos 5-HT2A-receptorn

ämnen Negativa effekter Depression farmakogenomik Abstrakt Serotonintoxicitet är resultatet av överskott av serotonin i centrala nervsystemet från serotonergiska läkemedel. Tidigare studier antyder ett samband mellan T102C-polymorfism av serotonin 2A (5-hydroxytryptamin 2A) receptorgen och serotonerga biverkningar med serotonerga läkemedel. Vi s

Genomfattande data avslöjar nya gener för metotrexatrespons i en stor kohort av juvenil idiopatisk artritfall

Genomfattande data avslöjar nya gener för metotrexatrespons i en stor kohort av juvenil idiopatisk artritfall

ämnen Juvenil idiopatisk artrit Farma Abstrakt Kliniskt svar på metotrexat (MTX) behandling för barn med juvenil idiopatisk artrit (JIA) visar betydande heterogenitet. För närvarande finns det inga pålitliga prediktorer för att identifiera icke-svarande: tidigare identifiering kan leda till en riktad behandling. Vi ge

Polygeniskt arv av paklitaxelinducerad sensorisk perifer neuropati som drivs av axonväxtgenuppsättningar i CALGB 40101 (Alliance)

Polygeniskt arv av paklitaxelinducerad sensorisk perifer neuropati som drivs av axonväxtgenuppsättningar i CALGB 40101 (Alliance)

ämnen Genetisk variation Perifera neuropatier farmakogenomik Abstrakt Perifer neuropati är en vanlig dosbegränsande toxicitet för patienter som behandlas med paklitaxel. För de flesta individer finns det inga kända riskfaktorer som predisponerar patienter för biverkningen, och patogenes för paclitaxel-inducerad perifer neuropati är okänd. Att best

Farmakogenomik för humana UDP-glukuronosyltransferasenzymer

Farmakogenomik för humana UDP-glukuronosyltransferasenzymer

Abstrakt UDP-glukuronosyltransferas (UGT) -enzymer innefattar en superfamilj av viktiga proteiner som katalyserar glukuronideringsreaktionen på ett brett spektrum av strukturellt olika endogena och exogena kemikalier. Glukuronidering är en av de viktigaste fas II-läkemedelsmetaboliserande reaktionerna som bidrar till biotransformation av läkemedel. De

Konsekvens av prediktiva signaturgener och klassificerare genererade med olika mikroarray-plattformar

Konsekvens av prediktiva signaturgener och klassificerare genererade med olika mikroarray-plattformar

ämnen Genuttrycksprofilering levertoxicitet farmakogenomik Förutsägbara markörer Abstrakt Microarray-baserade klassificerare och tillhörande signaturgener genererade från olika plattformar rapporteras rikligt i litteraturen; men användbarheten för klassificerare och signaturgener i plattformsprediktionsapplikationer är fortfarande stort sett osäker. Som en d

Microarrays som toxinsensorer

Microarrays som toxinsensorer

Microarrays kan användas för att identifiera toxineffekter på genuttryck, avgränsa avgiftningsvägar in vivo och potentiellt som sensorer för att övervaka människors exponering. "Varför är en korp som en skrivbord?" frågade det minnesvärda Mad Hatter i Lewis Carrolls Alice in Wonderland, 1 en gåta som har förundrat och underhållit läsarna i mer än ett sekel. Detta var inte

Interaktion mellan polymorfismer i renin – angiotensin-systemet och angiotensin-omvandlande enzymhämmare eller ß-blockerare och risken för hjärtinfarkt och stroke

Interaktion mellan polymorfismer i renin – angiotensin-systemet och angiotensin-omvandlande enzymhämmare eller ß-blockerare och risken för hjärtinfarkt och stroke

Abstrakt Denna studie undersöker om interaktionen mellan angiotensin-omvandlande enzym (ACE) -hämmare eller ß-blockerare och ACE-insertion / deletion (I / D) polymorfism eller angiotensinreceptor II typ 1 (AGTR1) 573C / T polymorfism modifierar risken för hjärtinfarkt (MI) eller stroke. Totalt inkluderades 4097 personer med högt blodtryck i denna studie. Läke

P-Adrenergic polymorfism av receptorgen och hemodynamisk respons på dobutamin under ekokardiografi med dobutamin-stress

P-Adrenergic polymorfism av receptorgen och hemodynamisk respons på dobutamin under ekokardiografi med dobutamin-stress

Abstrakt Vårt mål var att bestämma om ß 1- adrenerg receptor (ß 1 -AR) och ß 2 -AR genpolymorfismer påverkar hjärtfrekvens (HR), systoliskt blodtryck (SBP) och diastoliskt blodtryck (DBP) svar på dobutamin under dobutamin stress ekokardiografi (DSE). Patienter ( n = 163) som genomgick kliniskt indikerat DSE registrerades. Dobutam

BDNF Val66Met-genotyp och 6-månaders eftergivningsgrad vid sen-depression

BDNF Val66Met-genotyp och 6-månaders eftergivningsgrad vid sen-depression

ämnen Geriatri Farma Psykiatriska störningar Abstrakt Även om de inte observeras i yngre kohorter för vuxna, är hos äldre individer den hjärderiverade neurotrofiska faktorn ( BDNF ) Val66Met-polymorfism förknippad med risk för stor depressiv störning (MDD). Det är vidare associerat med subjektivt socialt stöd och magnetisk resonansavbildning (MRI) hyperintensiva lesioner, kliniska funktioner oberoende relaterade till MDD. Vi undersö

Förening av genotyper av CYP3A-klustret med midazolam-disposition in vivo

Förening av genotyper av CYP3A-klustret med midazolam-disposition in vivo

ämnen Farma farmakokinetik Den ursprungliga artikeln publicerades den 9 juni 2009 Rättelse till: The Pharmacogenomics Journal (2009) 9 , 319–326; doi: 10, 1038 / tpj.2009.21; publicerad online 9 juni 2009 Listan över medförfattare till denna artikel borde ha visat sig som Miao J, Jin Y, Marunde RL, Gorski CJ, Kim S, Quinney S, Radovich M, Li L och Hall SD. För

Farmakogenetiska studier vid depression: ett förslag till metodologiska riktlinjer

Farmakogenetiska studier vid depression: ett förslag till metodologiska riktlinjer

Abstrakt Farmakogenetiska studier på humörsjukdomar sprids snabbt efter de första rapporterna som kopplar genvarianter till behandlingsresultaten. Emellertid har ett stort antal metoder använts, vilket gör det svårt att jämföra resultat över studier och begränsa resultaten av representationerna. Specifik

Association of Disrupt in Schizophrenia 1 (DISC1) missense-varianter med ultra-resistent schizofreni

Association of Disrupt in Schizophrenia 1 (DISC1) missense-varianter med ultra-resistent schizofreni

ämnen Farma Schizofreni Abstrakt Tre vanliga missense-varianter av genen Disrupt in Schizophrenia 1 ( DISC1 ), rs3738401 (Q264R), rs6675281 (L607F) och rs821616 (S704C), har variabelt associerats med risken för schizofreni. I en fallkontrollstudie undersöker vi om dessa genvarianter är förknippade med schizofreni och ultresistent schizofreni (URS) i en population av franska kaukasiska patienter. URS

Hela genomuttrycksprofileringen av hepatit B-virustransfekterad cellinje avslöjar de potentiella målen för anti-HBV-läkemedel

Hela genomuttrycksprofileringen av hepatit B-virustransfekterad cellinje avslöjar de potentiella målen för anti-HBV-läkemedel

Abstrakt Infektion med hepatit B-virus (HBV) är ett stort hälsoproblem världen över, och få effektiva behandlingar har utvecklats. Det har nyligen rapporterats att hämning av värdcellproteiner kan förhindra virusinfektion. Det mänskliga genomet kan innehålla fler gener som krävs för HBV-infektion och replikation än det virala genomet. Ett systema

Användning av parvis markörkombination och rekursiv fördelning i en farmakogenetisk genomomfattande genomsökning

Användning av parvis markörkombination och rekursiv fördelning i en farmakogenetisk genomomfattande genomsökning

Abstrakt Syftet med farmakogenetisk forskning är att identifiera en genetisk markör, eller en uppsättning genetiska markörer, som kan förutsäga hur en given person kommer att reagera på en given medicin. För att söka efter sådana markörkombinationer som förutsäger biverkningar av läkemedel har vi utvecklat och använt två komplementära metoder på en farmakogenetisk studie av hypersensitivitetsreaktionen (HSR) associerad med behandling med abacavir, ett läkemedel som används för att behandla HIV-infekterade patienter . Våra resultat visar

Systematisk analys av dopaminreceptorgener (DRD1 – DRD5) i antipsykotisk inducerad viktökning

Systematisk analys av dopaminreceptorgener (DRD1 – DRD5) i antipsykotisk inducerad viktökning

ämnen Negativa effekter farmakogenomik Schizofreni Abstrakt Antipsykotisk inducerad viktökning har framkommit som en allvarlig komplikation i behandlingen av patienter med de flesta antipsykotika. Vi har genomfört den första djupgående undersökningen av dopaminreceptorgener med antipsykotisk inducerad viktökning. Total

Effekten av UGT1A1 * 28-allelen på överlevnad efter irinotekanbaserad kemoterapi: en samarbetsmetaanalys

Effekten av UGT1A1 * 28-allelen på överlevnad efter irinotekanbaserad kemoterapi: en samarbetsmetaanalys

ämnen Genetisk föreningsstudie Förutsägbara markörer Prognostiska markörer Abstrakt Hittills har studier av farmakogenetik med irinotekan mestadels fokuserat på effekten av UGT1A1 * 28-allelen på irinotekanrelaterad toxicitet. Emellertid är den kliniska användbarheten av rutinmässig UGT1A1 * 28 för att justera irinotekandos i förväg beroende på om UGT1A1 * 28 också påverkar patientens överlevnad efter irinotekanbehandling. Tidigare observa

En hjärnhärledd neurotrofisk faktor (BDNF) haplotyp är associerad med antidepressiva behandlingsresultat vid humörstörningar

En hjärnhärledd neurotrofisk faktor (BDNF) haplotyp är associerad med antidepressiva behandlingsresultat vid humörstörningar

Abstrakt Hjärnan härledd neurotrofisk faktor (BDNF) har studerats omfattande i förhållande till känsligheten för humörstörningar (MD), även om det återstår att klargöra om BDNF är ett mottaglighetsplats för MD-fenotyper, inklusive terapeutiskt svar på antidepressiva medel. Vi har utfört en enda-markör- och haplotypassocieringsstudie av åtta TagSNP-polymorfismer i den genomiska regionen innehållande BDNF-genen i 342 kontrollpersoner och 374 patienter med MD, och har testat sambandet med antidepressiva behandlingsresultat. Ingen av de åtta

Uttryck av gemcitabin- och cisplatinrelaterade gener vid icke-småcellig lungcancer

Uttryck av gemcitabin- och cisplatinrelaterade gener vid icke-småcellig lungcancer

Abstrakt Syftet med denna studie var att undersöka påverkan av histologi och analysställe (primär tumör kontra lymfkört) på uttrycket av gener involverade i gemcitabin- och cisplatinaktivitet vid icke-småcellig lungcancer (NSCLC). Tvärkomplementering-1 (ERCC1) för excisionsreparationer, human ekvilibrativ nukleosidtransportör-1 (hENT1), deoxicytidinkinas (dCK), 5′-nukleotidas (5′-NT), cytidindeaminas (CDA) och ribonukleotidreduktasreglerande underenheter ( RRM1 och RRM2) analyserades genom kvantitativ omvänd transkription-PCR i 88 mikrodissekterade prover från 69 kemoniva patienter. Resultaten

Farmakogenetisk profilering av CD133 är associerad med svarsfrekvens (RR) och progressionsfri överlevnad (PFS) hos patienter med metastaserande kolorektal cancer (mCRC), behandlade med bevacizumab-baserad kemoterapi

Farmakogenetisk profilering av CD133 är associerad med svarsfrekvens (RR) och progressionsfri överlevnad (PFS) hos patienter med metastaserande kolorektal cancer (mCRC), behandlade med bevacizumab-baserad kemoterapi

ämnen Kemoterapi Kolorektal cancer farmakogenomik Förutsägbara markörer Abstrakt Nyligen genomförda studier tyder på att CD133, ett ytprotein som används allmänt för isolering av stamceller i tjocktarmscancer, är associerat med tumörangiogenes och återfall. Vi antagade att genuttryckningsnivåer och variationer i kärnlinjer i CD133 kommer att förutsäga kliniskt resultat hos patienter med metastaserande kolorektal cancer (mCRC), behandlade i första linjen med 5-fluorouracil, oxaliplatin och bevacizumab (BV), och vi undersökte om det finns en korrelation med genuttrycksnivåer av CD133, vaskulär en

MTHFR 677C> T-polymorfismens roll i metotrexat-inducerad levertoxicitet: en metaanalys hos patienter med cancer

MTHFR 677C> T-polymorfismens roll i metotrexat-inducerad levertoxicitet: en metaanalys hos patienter med cancer

ämnen Genetisk variation levertoxicitet farmakogenomik Abstrakt Methotrexat (MTX), en av de viktigaste pelarna i behandlingen av olika former av cancer, är förknippad med utvecklingen av hepatotoxicitet. 677C> T-varianten (rs1801133) i metylentetrahydrofolatreduktasgenen ( MTHFR ) kan påverka utvecklingen av hepatotoxicitet. Re

Fosterhemoglobin i sigdcellanemi: genetiska determinanter för respons på hydroxyurea

Fosterhemoglobin i sigdcellanemi: genetiska determinanter för respons på hydroxyurea

Abstrakt Ökningen i fosterhemoglobin (HbF) som svar på hydroxyurea (HU) varierar bland patienter med sigdcellanemi. Tjugonio kandidatgener inom loci som tidigare rapporterats vara kopplade till HbF-nivå (6q22.3 – q23.2, 8q11 – q12 och Xp22.2 – p22.3), involverade i metabolism av HU och relaterade till erytroid progenitorproliferation studerades hos 137 sigdcellanemi-patienter behandlade med HU. Trehund

Farmakogenomik, förfäder och kliniskt beslutsfattande för globala populationer

Farmakogenomik, förfäder och kliniskt beslutsfattande för globala populationer

ämnen Farma Befolkningsgenetik Abstrakt Farmakogenomiskt relevanta markörer för läkemedelssvar och biverkningar av läkemedel är kända för att variera i frekvens mellan populationer. Vi undersökte mindre allelfrekvenser (MAF), genetisk mångfald ( F ST ) och befolkningsstruktur av 1156 genetiska varianter (inklusive 42 kliniskt verkningsbara varianter) i 212 gener involverade i läkemedelsabsorption, distribution, metabolism och utsöndring (ADME) i 19 populationer ( n = 1478). Det var st

En farmakogenetisk studie av ADRB2-polymorfismer och indacaterolrespons hos KOL-patienter

En farmakogenetisk studie av ADRB2-polymorfismer och indacaterolrespons hos KOL-patienter

ämnen Farma Andningsvägssjukdomar Abstrakt Genetisk variation i ADRB2-genen har antagits att ha en roll i differentiellt svar på beta-agonist (BA) -terapi vid astma. Studieresultaten har dock varit inkonsekventa och frågan förblir kontroversiell. Påverkan av genetisk variation av ADRB2 på BA-respons hos patienter med kronisk obstruktiv lungsjukdom (KOL) har inte studerats noggrant. Vi ge

Somatisk farmakogenomik vid cancer

Somatisk farmakogenomik vid cancer

Abstrakt Många av de initiala exemplen på den kliniska användbarheten av farmakogenetik klargjordes inom området onkologi. Dessa exempel baserades till stor del på förekomsten av genetisk variation i groddar som påverkar metabolismen av cytotoxiska läkemedel. Med utvecklingen av kinasinhibitorer, läkemedel som är utformade för att företrädesvis rikta in förändrade proteiner som driver onkogenes, har farmakogenetik i cancer ändrats till att förstå de somatiska skillnaderna som bestämmer svaret på dessa målmedier. Det blir allt tydli

DPP6 som en kandidatgen för neuroleptisk-inducerad tardiv dyskinesi

DPP6 som en kandidatgen för neuroleptisk-inducerad tardiv dyskinesi

ämnen Genetisk predisposition för sjukdom Rörelsestörningar farmakogenomik Schizofreni Abstrakt Vi implementerade en tvåstegssätt för att upptäcka potentiella prediktorgenvarianter för neuroleptisk inducerad tardiv dyskinesi (TD) hos schizofrena individer. Först screenade vi föreningar genom att använda en genombredd (Illumina HumanHapCNV370) SNP-grupp i 61 japanska schizofrenipatienter med behandlingsresistenta TD och 61 japanska schizofrenipatienter utan TD. Därefter u