Inuti uscap-tidskrifterna | laboratorieundersökning

Inuti uscap-tidskrifterna | laboratorieundersökning

Anonim

ämnen

  • Laboratorietekniker och förfaranden
  • Patologi

Modern patologi

Mutationer i kolorektala neuroendokrina karcinom

Neuroendokrina karcinom (NEC) i kolorektum tycks dela många genetiska förändringar med kolorektala adenokarcinom. I själva verket visar många neuroendokrina karcinom intilliggande glandulära adenomatösa eller adenokarcinomatösa komponenter. Inga definitiva genetiska data har samlats in om de molekylära avvikelser som är karakteristiska för neuroendokrina karcinom. Med hjälp av analyser av 15 kolorektala NEC: er undersökte Woischke et al de delade genetiska förändringarna och de tre mutationerna med de högsta allelfrekvenserna: TP53, KRAS och APC . Upptäckten av identiska KRAS- mutationer i både körtel- och NEC-komponenter antyder ett klonalt ursprung för båda typerna av tumörer, med ännu inte undersökta oberoende ytterligare mutationsutveckling av de två komponenterna efter klonal divergens. Den relativt lilla andelen delade mutationer mellan de neuroendokrina och körtelkomponenterna antyder en tidig divergens. Gruppen föreslår att med ökad förståelse för molekylärbiologin hos dessa tumörer kan en distinkt klassificering bättre stödja exakt karaktärisering och klinisk hantering av dessa neoplasmer i framtiden.

Lågklassig trippelnegativ bröstneoplasi

Acinic cellkarcinom är en indolent invasiv bröstcancer, och mikroglandulär adenos är en neoplastisk spridning. Geyer och kollegor bedömde somatiska mutationer, infogningar, borttagningar och förändringar av kopianummer i bröstkarcinom i acinicceller. Med hjälp av trippelnativ bröstcancervävnad som modell identifierade gruppen TP53 som den enda mycket återkommande muterade genen i mikroglandulär adenos (75%) och acinisk cellkarcinom (88%). De föreslår att mikroglandulära adenoser / atypiska mikroglandulära adenoser och aciniska cellkarcinom kan utgöra ett spektrum av trippelnegativa bröstcancer med låg kvalitet. De utvecklade en evolutionär modell av trippelnegativa bröstneoplasmer, med varierande karakteristiska TP53- mutationer som skiljer två grupper av trippelnegativ bröstcancer: låggradig, som sällan metastaserar (representerad av acincell och mikroglandulär adenos) och högkvalitativ, som kan utvecklas från lågklassig form. De drar slutsatsen att mer forskning behövs för att bestämma hur låggradig cancer utvecklas till högkvalitativt, och konsekvenserna för bröstcancervård.

Laboratorieundersökning

CD68, en immunmarkör med ett dagjobb

Chistiakov et al granskade användningen av CD68 som en cytokemisk markör vid histokemisk analys av inflammation, cancer och andra immunohistopatologiska tillstånd. De noterar att funktionen av CD68 har varit lite undersökt, men dess föredragna placering inom sena endosomer antyder en roll i peptidtransport / antigenbearbetning. Gruppen bedömde CD68: s roll i osteoklastutveckling, i vilken makrofagkolonistimulerande faktor och kärnfaktor-KB visades inducera CD68-uttryck. I cancer visades CD68 uttryckas i metastatiska tumörceller. Tumörceller kan vida uttrycka immunmarkörer för att undkomma makrofagmedierad fagocytos och cellskadande effekter från cytotoxiska CD8 + T-celler under invasion av en normal, icke-tumörvävnadsmiljö. Forskningen har gjort det möjligt för gruppen att identifiera nya roller för CD68 utanför dess etablerade användning som makrofagmarkör i histologi. Dess roll i immunitet är spännande, men det återstår mycket att undersöka.

Kovalent avsatta färgämnen för immunohistokemi

Day et al använde en multiplexanalys av biomarkörer med reporterfärger med spektrala egenskaper som möjliggör diskriminering av signaler. Den breda absorbansen av kromogener som används för immunohistokemi gör dem svåra att kombinera. Fluorescerande signaler är smalare och kan kombineras, men de är inte lämpliga för ljusmikroskopi. Forskarna syntetiserade och karakteriserade en familj av tyramidkromogener och bedömde deras deponering in situ med hjälp av kovalent avsättning av utvalda färgämnen konjugerade med tyramin. Förmågan att blanda de nya kromogenerna och generera nya färger gjorde det möjligt för dem att söka flera biomarkörer i en enda analys på en enda vävnadssektion. De smala absorbansbanden gjorde det möjligt att enkelt skilja kolokaliserade biomarkörer från enskilda biomarkörer. Denna teknik kommer att ha intressanta tillämpningar inom translationell forskning, men kanske också i den kliniska världen eftersom traditionell morfologisk topologi av histologisektioner är bättre visualiserad med ljus än med fluorescerande mikroskopi.

nature.com/pathology

Mutationsackumulering i vuxna stamceller

Blokzijl et al försökte utvärdera de oundvikliga slumpmutationer som uppstår under DNA-replikation i humana vuxna stamceller och mutationernas förhållande till cancerrisk. Efter att ha utvärderat genomomfattande mutationsmönster i vuxna stamceller i olika vävnader från mänskliga givare i åldrarna 3 till 87 år noterade forskarna ett positivt samband mellan antalet somatiska punktmutationer och givarens ålder. Två kända signaturer av mutationer undersöktes. Signatur A visades i deras datauppsättning för att korrelera med den linjära trenden, vilket indikerar att mutationer med den signaturen ackumuleras med ålder, medan signatur B inte visade någon sådan korrelation. Eftersom cellerna från många olika givare analyserades utan att kontrollera med avseende på livsstil eller kön, ledde likheterna i punktmutationsfrekvens och mutationsspektrum till gruppen att dra slutsatsen att miljöriskfaktorer för mutation hade en minimal effekt på det mutationslandskap i detta sammanhang.

Nature , 2016; 538: 260-264; doi: 10, 1038 / nature.19768

Schwannoma genomics

Agnihotri et al identifierade genomiska avvikelser som är vanliga för sporadiska schwannomas. Bristen på förståelse för mekanismerna med vilka dessa tumörer utvecklas gör rest- och strålbehandlade schwannomas till en klinisk utmaning. Gruppen identifierade inte bara de förväntade återkommande mutationerna i NF2 utan också avvikelser i de kromatinmodifierande generna ARID1A, ARID1B och DDR1 . De flesta schwannomas (76%) var förknippade med 22q-deletion eller NF2- mutationer, som i sin tur observerades i signifikant högre andelar i vestibulära schwannomas än i spinal schwannomas. En ny SH3PXD2A-HTRA1 -genfusion identifierades i 10% av fallen. Detta transkriberas till mRNA och översätts till ett protein som leder till ökad ERK-vägaktivitet. Resultaten utvidgar den genomiska förståelsen för schwannomas utöver NF2- inaktivering och ger ytterligare insikter i deras patogenes.

Nature Genetics , 2016; 48: 1339-1348; doi: 10, 1038 / ng.3688

PPARG- variantsklassificering

Majithia et al försökte klassificera de funktionella skillnaderna mellan varje 9.595 varianter av PPARG (kodande för peroxisomproliferatoraktiverad receptor y). Det är känt att cirka 1 av 500 personer har missense-varianter av PPARG , av vilka majoriteten inte har någon funktionell påverkan. Genom att generera ett bibliotek med alla möjliga permutationer med en enda aminosyra för expression i humana makrofager, utvecklade författarna en poolad funktionell analys av alla proteinvarianter. Hos diabetespatienter diskriminerades analyserna framgångsrikt mellan icke-patogena varianter och Pro12Ala-varianten kopplad till predisposition av diabetes. Fem av sex varianter identifierade hos patienter med familjär lipodystrofi 3 klassificerades som patogena, vilket resulterade i defekt protein. Konventionella prediktormodeller för mutationsdeleteriousness kunde inte skilja mellan patogena och godartade varianter. Denna nya modell kommer att stödja molekylär diagnostik genom en webbapplikation utvecklad av författarna, vilket möjliggör bred och effektiv delning av denna information.

Nature Genetics , doi: 10.1038 / ng.3700

Emma Judson bidrog till dessa recensioner.

Författare