Ärftlighet (Maj 2020)

Tidigare klimatförändringar förklarar fylogeografin av Vitellaria paradoxa över Afrika

Tidigare klimatförändringar förklarar fylogeografin av Vitellaria paradoxa över Afrika

ämnen biogeography Klimatförändring phylogeny Växtgenetik Den ursprungliga artikeln publicerades den 16 mars 2011 Rättelse till : Heredity (2011) 107 , 174–186; doi: 10, 1038 / hdy.2011.5 Efter publiceringen tidigare i år i bind 107, märkte författarna ett typografiskt fel, beträffande studiens era, i diskussionsavsnittet. Inom avsn

Kinasortiment i unga stimar i vilda guppypopulationer

Kinasortiment i unga stimar i vilda guppypopulationer

ämnen Beteende ekologi Genetisk variation Modell ryggradslösa djur Abstrakt Gruppering ger många potentiella fördelar för individer när det gäller foder och skydd mot rovdjur. Det har emellertid föreslagits att individer skulle kunna få ytterligare fördelar när det gäller indirekt kondition genom att gruppera med släktingar. Överraskand

U1 snDNA-kluster i gräshoppor: kromosomal dynamik och genomisk organisation

U1 snDNA-kluster i gräshoppor: kromosomal dynamik och genomisk organisation

ämnen cytogenetik Abstrakt Spliceosomen, som utgörs av en proteinset associerad med liten kärn-RNA (snRNA), är ansvarig för mRNA-mognad genom intronavlägsnande. Bland snRNA-gener är U1 generellt en bevarad repetitiv sekvens. För att avslöja kromosomal / genomisk dynamik hos denna multigene-familj i gräshoppor, kartlade vi U1-gener genom fluorescens in situ- hybridisering i 70 arter som tillhör familjerna Proscopiidae, Pyrgomorphidae, Ommexechidae, Romaleidae och Acrididae. Tydliga k

Rumslig heterogenitet i styrkan av selektion mot skadliga alleler och mutationsbelastningen

Rumslig heterogenitet i styrkan av selektion mot skadliga alleler och mutationsbelastningen

ämnen Evolutionär ekologi Mutation Abstrakt Enligt nuvarande uppskattningar av genomisk skadlig mutationsgrad (som ofta är i storleksordningen 0, 1–1) kan mutationsbelastningen (definierad som en minskning av en befolknings genomsnittliga kondition på grund av förekomsten av skadliga alleler) vara viktig i många populationer. I det

Demografisk historia, nuvarande expansion och framtida förvaltningsutmaningar för vildsvinpopulationer på Balkan och Europa

Demografisk historia, nuvarande expansion och framtida förvaltningsutmaningar för vildsvinpopulationer på Balkan och Europa

ämnen Genetiska markörer PCR-baserade tekniker Abstrakt Vildsvin ( Sus scrofa ), en av de mest utbredda djurarterna, har kommit in i ett steg med kontinuerlig tillväxt i Europa och kan till och med betraktas som en skadedjurart. Vi analyserade mikrosatellitvariabilitet i 723 vildsvin från hela Europa, inklusive norra Dinaric Balkan. Vå

Genetisk och funktionell modularitet: hur löser en organisme ett nästan oändligt genetiskt / miljömässigt problemutrymme?

Genetisk och funktionell modularitet: hur löser en organisme ett nästan oändligt genetiskt / miljömässigt problemutrymme?

ämnen Experimentella organismer Genetisk variation Modularitet, begreppet att en grupp av objekt fungerar tillsammans och de är mindre kopplade till artiklar inom andra grupper, har varit ett nyckelbegrepp som ligger till grund för många forskningsfält från kvantitativ genetik till beräkningsbiologi. I gen

Variation och begränsning i växtutveckling och utveckling

Variation och begränsning i växtutveckling och utveckling

Abstrakt Målet med denna korta översyn är att ta hänsyn till de sammanhängande fenomenen fenotypisk variation och genetisk begränsning med avseende på växtdiversitet. De unika aspekterna av växter, inklusive stillsam vana, modulär tillväxt och olika utvecklingsprogram uttryckta på fytomer nivå, förtjänar en specifik undersökning av den genetiska grunden för deras fenotypiska variation, och hur de upplever och undviker genetisk begränsning. Många QTL-studie

Teoretiska ramar för befolkningsgenetik med somatiska mutationer beaktade: tillämpning för att kopiera antalvariationer hos människor

Teoretiska ramar för befolkningsgenetik med somatiska mutationer beaktade: tillämpning för att kopiera antalvariationer hos människor

ämnen Mutation Befolkningsgenetik Strukturell variation Abstrakt Traditionellt fokuserar populationsgenetik på dynamiken i frekvenser av alleler som förvärvas av mutationer på groddar, eftersom endast sådana mutationer är ärftliga. Typiska experiment med genotyper använder emellertid DNA från vissa somatiska vävnader, såsom blod, som har somatiska mutationer vid den nuvarande generationen utöver kimlinjemutationer som har ackumulerats sedan provets senaste gemensamma förfader. Denna vanlig

Flera genomiska signaturer för selektion hos getter och får som är inhemska i en varm torr miljö

Flera genomiska signaturer för selektion hos getter och får som är inhemska i en varm torr miljö

ämnen Evolutionär biologi Genetik Abstrakt Getar och får är mångsidiga husdjur som har integrerats i olika miljöer och produktionssystem. Naturligt och konstgjort urval har format variationen i de två arterna, men naturligt urval har spelat den viktigaste rollen bland inhemska flockar. För att undersöka signaler om naturligt urval analyserade vi genotypdata som genererades med getten och får 50K SNP BeadChips från Barki getter och får som är ursprungliga i en varm torr miljö i Egypts kustzon i västra öknen. Vi identifiera

Temporär variation i pollenspridning och avelsstruktur i ett bi-pollinerat neotropiskt träd

Temporär variation i pollenspridning och avelsstruktur i ett bi-pollinerat neotropiskt träd

ämnen Modellen växter Växtuppfödning Pollinering Abstrakt Variation mellan blomningssäsonger under blommningstiden, synkroni och blomningslängd och fluktuationer i överflödet av pollinatorer kan orsaka en variation i pollenspridningsavståndet. I denna studie analyserade vi den tidsmässiga variationen i pollenspridning och avelsstruktur i den neotropiska trädarten Tabebuia aurea (Bignoniaceae) och utvärderade pollenspridning mellan en population i reserven och en lapp av isolerade individer på kanten av reservatet och testade hypotesen att isolerade individer sjunker för pollen. Alla vuxna t

Motståndskraften i genetik för skogsfragmentering - inte längre en paradox - vi tittade bara på fel plats

Motståndskraften i genetik för skogsfragmentering - inte längre en paradox - vi tittade bara på fel plats

ämnen Skogsbruk Befolkningsgenetik Den ursprungliga artikeln publicerades den 15 juli 2015 Rättelse till: Heredity (2015) 115, 97–99; doi: 10, 1038 / hdy.2015.40 Författarna vill ändra datumet för följande referens från 2010 till 2011. Rätt referens ska visas på följande sätt: Bacles CFE, Jump AS (2011). Ta ett träd

Genomfattande assositionsstudie med flera egenskaper baserat på huvudkomponentanalys för kvarvarande kovariansmatris

Genomfattande assositionsstudie med flera egenskaper baserat på huvudkomponentanalys för kvarvarande kovariansmatris

ämnen Genomfattande föreningsstudier En rättelse till denna artikel publicerades den 11 mars 2015 Abstrakt Med tanke på nackdelarna med att implementera multivariatanalys för kartläggning av flera egenskaper i genombreddsassocieringsstudie (GWAS), har huvudkomponentanalys (PCA) använts i stor utsträckning för att generera oberoende "superdrag" från de ursprungliga multivariata fenotypiska egenskaperna för den univariata analysen. Parameter

Genflöde och befolkningsstruktur för en vanlig jordbruksvild art (Microtus agrestis) under olika landhanteringsregimer

Genflöde och befolkningsstruktur för en vanlig jordbruksvild art (Microtus agrestis) under olika landhanteringsregimer

ämnen Lantbruk Bevarande biologi Befolkningsgenetik Abstrakt Påverkan av landskapsstruktur och landhantering på spridning av populationer av vilda arter som lever i jordbrukslandskapet undersöktes med fokus på fältvollen ( Microtus agrestis ) i tre olika områden i Danmark med användning av molekylära genetiska markörer. De vikti

Bryan Clarke

Bryan Clarke

ämnen Vetenskapligt samhälle Bryan Clarke, som har dött vid 81 års ålder, var en pionjär inom ekologisk genetik. Han studerade under EB Ford och AJ Cain i Oxford och var en del av den generation som räddade befolkningen och evolutionär biologi från dess långa flirtation med Scylla av frusen matematisk exakthet som inte var stämd av fakta och Charybdis för datainsamling fri från idéer. När jag titt

Genetisk arkitektur av resistens i Daphnia värdar mot två arter av värdspecifika parasiter

Genetisk arkitektur av resistens i Daphnia värdar mot två arter av värdspecifika parasiter

ämnen Parasitutveckling Parasitgenetik Abstrakt Att förstå den genetiska arkitekturen för värdresistens är nyckeln för att förstå utvecklingen av värd-parasitinteraktioner. Evolutionsmodeller antar ofta enkel genetik baserad på få loci och stark epistas. Det är emellertid okänt om dessa antaganden gäller naturliga populationer. Med hjälp av

Blomsterutveckling: ensidig evolution eller två? Ett svar till Ennos

Blomsterutveckling: ensidig evolution eller två? Ett svar till Ennos

Även om termen "samutveckling" myntades för mindre än 50 år sedan (Ehrlich och Raven, 1964), över 100 år före det Darwin beskrev först processen för att redogöra för matchningen av tung- och rörlängderna av biarter och klöverarten de besökte (Darwin, 1859). Han berättade om denna process när han beskrev den utomordentligt långa sporen för Angraecum sesquipedale och förutspådde en mollgörare med en lika lång tunga (Darwin, 1862). Darwin föreställde si

Kvantitativ genetisk variation i kontrollen av apoptos i äggstockarna under olika miljöer

Kvantitativ genetisk variation i kontrollen av apoptos i äggstockarna under olika miljöer

Abstrakt Fertilitetsförlust hos annars friska individer kan vara en evolutionsproblem. De flesta studier om utvecklingen av livslängden efter reproduktion fokuserar på konditioneffekterna av överlevnad efter den senaste reproduktionens ålder. Ett komplementärt tillvägagångssätt, som till stor del har försummats, är att utveckla en förståelse för variationen i den mekanism som ligger bakom förlust av fertilitet, äggstocksapoptos. Variationer i

Antagonistisk pleiotropi kan hjälpa selektion på befolkningsnivå för att bibehålla genetisk polymorfism för överföringshastighet i en modell fytopatogen svamp

Antagonistisk pleiotropi kan hjälpa selektion på befolkningsnivå för att bibehålla genetisk polymorfism för överföringshastighet i en modell fytopatogen svamp

Abstrakt Det har teoretiskt visats att förhållandena för upprätthållande av polymorfism vid pleiotropiska loki med antagonistiska effekter på konditionskomponenter är ganska restriktiva. Här använder vi en metapopuleringsmodell för att undersöka om antagonistisk pleiotropi kan hjälpa till att upprätthålla polymorfism som involverar vanliga skadliga alleler i fytopatogen svamp Microbotryum violaceum . Denna svamp

Omfattande mitokondriell introgression i nordamerikanska Great Black-backed Gulls (Larus marinus) från American Herring Gull (Larus smithsonianus) med liten kärn-DNA-påverkan

Omfattande mitokondriell introgression i nordamerikanska Great Black-backed Gulls (Larus marinus) från American Herring Gull (Larus smithsonianus) med liten kärn-DNA-påverkan

ämnen Evolutionär biologi Befolkningsgenetik Abstrakt Nyligen genomförda genetiska studier har visat att introgressionstakten bland loci i hög grad kan variera beroende på deras placering i genomet. I synnerhet har flera fall av mito-nukleära diskordanser rapporterats för ett brett spektrum av organismer. I den

Om den roll som bärkapaciteten och förfädernas befolkningstorlek spelade under en intervallutvidgning

Om den roll som bärkapaciteten och förfädernas befolkningstorlek spelade under en intervallutvidgning

ämnen Evolutionär teori Abstrakt De flesta arter är strukturerade och olika populationsgenetikmodeller har föreslagits för att undersöka deras historia. För matematisk spårbarhet gör de flesta av dessa modeller det förenklande antagandet om jämvikt. Här fokuserar vi på egenskaperna för en icke-kvävlig rumslig, explicit modell, intervallutvidgningar (RE). Trots deras ö

Variation i kompisens preferens över en husmus-hybridzon

Variation i kompisens preferens över en husmus-hybridzon

Abstrakt Det är känt att reproduktiv karaktärförskjutning sker vid gränserna för en sekundär kontaktzon mellan de två europeiska underarten av husmus (i Jylland, Danmark), där val mot hybridisering sker. I denna studie bedömdes mönster av kompensationspreferens i naturligt förekommande hybrider i de två underarterna. Val av komp

Vad förklarar sällsynta och iögonfallande färger i en snigel? Ett test av tidsseriedata mot modeller av drift, migrering eller urval

Vad förklarar sällsynta och iögonfallande färger i en snigel? Ett test av tidsseriedata mot modeller av drift, migrering eller urval

ämnen Genetisk variation Abstrakt Det är spännande att iögonfallande färgmorfor hos en bytesart kan bibehållas vid låga frekvenser vid sidan av kryptiska morfer. Negativt frekvensberoende val av rovdjur som använder sökbilder ('apostatiskt urval') föreslås ofta utan att avvisa alternativa förklaringar. Med hjälp

Hög Y-kromosomal mångfald och låg besläktning mellan faderliga linjer på kommunal skala i de västeuropeiska lågländerna under efternamnet etablering

Hög Y-kromosomal mångfald och låg besläktning mellan faderliga linjer på kommunal skala i de västeuropeiska lågländerna under efternamnet etablering

ämnen Strukturell variation Abstrakt Det finns begränsad kunskap om den biologiska besläktningen mellan medborgarna och om den demografiska dynamiken i byar, städer i Västeuropa före 1600-talet. Genom att kombinera Y-kromosomala genotyper, fördjupade släktforskningar och efternamn i en strikt genetisk genealogisk strategi, är det möjligt att ge insikter om den genetiska mångfalden och besläktningen mellan inhemska faderska linjer inom ett visst samhälle vid tidpunkten för att efternamnet antogs. För att få d

En insekt-endosymbiont conundrum

En insekt-endosymbiont conundrum

Forskning under de senaste 20 åren har visat att en stor del av insektsarter har intima föreningar med symbiotiska bakterier som ofta har stora effekter på deras biologi. Vissa symbionter är ömsesidiga som ökar värdens kondition, medan i andra fall värden inte får någon nytta eller till och med lider av att bära mikroorganismen. Bakterier

Arv av spridningshastighet och andra livshistoriska drag i Glanville fritillärfjäril

Arv av spridningshastighet och andra livshistoriska drag i Glanville fritillärfjäril

Abstrakt Att känna till variansen och ärftligheten ( h 2 ) av livshistoriska drag i befolkningar som lever under naturliga förhållanden är nödvändig för en mekanistisk förståelse av respektive evolutionära processer. Jag uppskattade arv av flera livshistoriska drag, inklusive spridningshastighet, kroppsmassa, ålder vid första reproduktionen, äggmassa, kopplingsstorlek och livslång reproduktionsframgång, i Glanville fritillfjäril ( Melitaea cinxia ) med hjälp av föräldra-avkomma regression. Experiment genomfö

Räckviddskift av Potentilla fruticosa på Qinghai-Tibetan-platån under glaciala och interglaciala perioder avslöjade genom kloroplast-DNA-sekvensvariation

Räckviddskift av Potentilla fruticosa på Qinghai-Tibetan-platån under glaciala och interglaciala perioder avslöjade genom kloroplast-DNA-sekvensvariation

Abstrakt Qinghai-Tibetan-platån är en av de mest omfattande livsmiljöerna för alpina växter i världen. Därför kan mönstren för genetisk variation i populationer på platån avslöja den detaljerade demografiska historien för alpina växter. Vi analyserade den geografiska strukturen för kloroplastmatta K-sekvensvariation i Potentilla fruticosa L. (Rosaceae), en

Molekylära och cellulära mekanismer för mångfald inom vinrankor

Molekylära och cellulära mekanismer för mångfald inom vinrankor

Abstrakt En vinrankasort består av en rad kloner som härstammar av vegetativ förökning från en enda utvald vinstock som är odlad från en enda planta. En majoritet av klonerna inom en variation är identiska, men vissa kan visa divergerande genotyper och i viss mån divergerande fenotyper. Polymorfism beror främst på somatiska mutationer som förekommer naturligt under växttillväxt. Olika typer

Genetisk kartläggning av sterila gener med epistas i backcross-mönster

Genetisk kartläggning av sterila gener med epistas i backcross-mönster

ämnen Genetisk interaktion Genetisk kartläggning Växthybridisering Abstrakt Kartläggning av sterila gener är en väsentlig fråga som bör lösas för utredning av sterilitetsmekanismen vid bred hybridisering av växter. Emellertid kan de tidigare utvecklade metoderna inte ta itu med problemet med att kartlägga sterila loci med epistas. I denna st

Karakterisering av röntgengenererade blommiga mutanter som bär borttagningar vid S-locus hos distylous Turnera subulata

Karakterisering av röntgengenererade blommiga mutanter som bär borttagningar vid S-locus hos distylous Turnera subulata

ämnen Modellen växter Mutation Växtgenetik Den ursprungliga artikeln publicerades den 14 april 2010 Rättelse till: Heredity (2010) 105, 235–243; doi: 10, 1038 / hdy.2010.39; publicerad online 14 april 2010 Författarna har upptäckt ett fel som de vill korrigera. Figur 3, karaktärisering av 12 S- fokusmutanter, visar två markörer ( RP81E18 och P9SP1 ) på avstånd av <0, 5 respektive 0, 5 cM. Det faktisk

Upptäckt av epistatiska interaktioner i populationer som kartlägger föreningar: ett exempel från tetraploid potatis

Upptäckt av epistatiska interaktioner i populationer som kartlägger föreningar: ett exempel från tetraploid potatis

ämnen Beräkningsmodeller Genetisk kartläggning Växtgenetik Abstrakt Epistatiska interaktioner mellan loci förväntas bidra väsentligt till variationen i kvantitativa egenskaper. Syftet med vår forskning var att (i) jämföra en klassisk metod med blandad modell med en kombinerad blandad modell och analys av variansmetod för att upptäcka epistatiska interaktioner; (ii) undersöka med hjälp av datasimuleringar den statistiska kraften för att detektera additiv – additiv, additiv – dominans och dominans – dominans epistatiska interaktioner och (iii) upptäcka epistatiska interaktioner mellan kandidatgen

Somatisk skadlig mutationsgrad i en woody växt: uppskattning från fenotypiska data

Somatisk skadlig mutationsgrad i en woody växt: uppskattning från fenotypiska data

ämnen Inavel Mutation Växtgenetik Abstrakt Vi genomförde kontrollerade kors i populationer av den långlivade klonala busken, Vaccinium angustifolium (lowbush blåbär) för att uppskatta avelsdepression och mutationsparametrar associerade med somatisk skadlig mutation. Inavelsdepression var hög, med många växter som inte lyckades sätta frukt efter självbestämning. Vi jämförde

Kontrasterande svar på selektion i klass I och klass IIa huvudhistokompatibilitetslänkade markörer hos lax

Kontrasterande svar på selektion i klass I och klass IIa huvudhistokompatibilitetslänkade markörer hos lax

ämnen Evolutionär ekologi Genetiska markörer Iktyologi Befolkningsgenetik Abstrakt Jämförelse av nivåer och mönster av genetisk variation i naturpopulationer antingen över loci eller mot neutral förväntan kan ge insikt i lokusspecifika skillnader i styrka och riktning för evolutionära krafter. Vi använde

Låg genetisk mångfald och stark befolkningsstruktur formad av antropogen livsmiljöfragmentering i en kritiskt hotad primat, Trachypithecus leucocephalus

Låg genetisk mångfald och stark befolkningsstruktur formad av antropogen livsmiljöfragmentering i en kritiskt hotad primat, Trachypithecus leucocephalus

ämnen Bevarande biologi Befolkningsgenetik Abstrakt Habitatfragmentering kan starkt påverka befolkningens genetiska struktur och minska den genetiska mångfalden och livskraften hos små och isolerade populationer. Den vita huvudet langur ( Trachypithecus leucocephalus ) är en kritiskt hotad primatart som lever i en mycket fragmenterad och mänsklig modifierad livsmiljö i södra Kina. Vi und

Analys av genombredd struktur, mångfald och fin kartläggning av Mendeliska drag i traditionella kycklingar och byar

Analys av genombredd struktur, mångfald och fin kartläggning av Mendeliska drag i traditionella kycklingar och byar

ämnen Genetisk variation Genomfattande föreningsstudier Genotyping och haplotyping Befolkningsgenetik Abstrakt Omfattande fenotypisk variation är ett vanligt kännetecken bland bykycklingar som finns i stora delar av utvecklingsländerna, och i traditionella kycklingraser som har blivit konstgjorda utvalda för egenskaper som fjädrar. Vi pr

RNAi och epigenetics: Pol IV är en matchmaker av små RNA som möter kromatin

RNAi och epigenetics: Pol IV är en matchmaker av små RNA som möter kromatin

I olika arter av eukaryoter kan dubbelsträngat RNA (dsRNA) orsaka ett brett spektrum av gendämpande fenomen på ett sekvensspecifikt sätt, antingen på transkriptionell nivå eller på posttranskriptionsnivå (Matzke och Birchler, 2005). Den huvudsakliga biologiska rollen för sådan tystnad är vanligtvis att skydda från invasiva nukleinsyror inklusive virus och retrotransposoner och att bibehålla den kromosomala stabiliteten. I växtcelle

Ål mysterium: tiden gör en skillnad

Ål mysterium: tiden gör en skillnad

Befolkningsgenetiska studier som rapporterar till synes negativa resultat, såsom brist på signifikanta skillnader, hamnar sällan i rubrikerna till ledande vetenskapliga tidskrifter. Verket av Palm et al. (2009) gör emellertid exakt detta genom att använda en omfattande tidsmässig datauppsättning för att visa att den europeiska ålen ( Anguilla anguilla ) trots flera nya påståenden fortfarande kan betraktas som en enda, rumsligt homogen befolkning. De europe

Uppskattning av anisotropisk pollenspridning: en fallstudie i Quercus lobata

Uppskattning av anisotropisk pollenspridning: en fallstudie i Quercus lobata

Abstrakt Pollens spridningsfördelning är ett viktigt inslag i storleken på växtpopulationer. De flesta metoder som syftar till att uppskatta spridningskurvan antar att pollenutbredningen är isotropisk, men bevis tyder på att detta antagande inte gäller för många växtarter, särskilt vindpollinerade arter som är utsatta för rådande vind under pollineringssäsongen. Vi föreslår h

Vad orsakar växling av parningssystem i växter? Arabidopsis lyrata som en fallstudie

Vad orsakar växling av parningssystem i växter? Arabidopsis lyrata som en fallstudie

ämnen Självkompatibilitet En rättelse till denna artikel publicerades den 7 december 2016 Abstrakt Den genetiska uppdelningen av självkompatibilitet (SI) och efterföljande parningssystem förflyttas till inavel har fascinerat evolutionära genetiker i årtionden. De flesta av våra kunskaper härrör från interspecifika jämförelser mellan inavlingsarter och deras utåtriktade släktingar, där slutsatser kan förvirras av sekundära mutationer som uppstod efter den första förlusten av SI. Här studerar vi en

Rensa skadliga mutationer i bevarandeprogram: kombinerar optimala bidrag med inavlade parningar

Rensa skadliga mutationer i bevarandeprogram: kombinerar optimala bidrag med inavlade parningar

ämnen Biologisk mångfald Bevarande biologi Inavel Befolkningsgenetik Abstrakt Bevaringsprogram syftar till att minimera förlusten av genetisk mångfald, vilket gör att populationer kan anpassa sig till potentiella miljöförändringar. Detta kan uppnås genom att beräkna hur många avkommor varje individ bör bidra till nästa generation för att minimera den globala coancestry. En oönskad k

Temporära förändringar i allelfrekvenser men stabil genetisk mångfald under de senaste 40 åren i den irländska havspopulationen av thornback ray, Raja clavata

Temporära förändringar i allelfrekvenser men stabil genetisk mångfald under de senaste 40 åren i den irländska havspopulationen av thornback ray, Raja clavata

Abstrakt Strålar och skridskor är en oundviklig del av bifångsten i bottenfisket. Under de senaste 40 åren har taggstrålen ( Raja clavata ) minskat i antal och till och med försvunnit i vissa områden, vilket ledde till oro för genetisk risk. Av denna anledning uppskattades den effektiva befolkningsstorleken ( N e ), migrationsgraden ( m ) och temporära förändringar i den genetiska mångfalden för populationen av tornbackstrålar i Irländska havet och Bristol Channel. Med användnin

Kycklinghemning: ett uppdaterat perspektiv baserat på mitokondriella genomer

Kycklinghemning: ett uppdaterat perspektiv baserat på mitokondriella genomer

ämnen Genetisk variation Mitokondrialt genom phylogeny Abstrakt Inhemska kycklingar ( Gallus gallus domesticus ) fyller olika roller, allt från mat och underhållning till religion och prydnad. För att kartlägga dess genetiska mångfald och spåra historien om domesticering undersökte vi totalt 4938 mitokondriella DNA (mtDNA) fragment inklusive 2843 tidigare publicerade och 2095 de novo- enheter från 2044 inhemska kycklingar och 51 röda djungfåglar ( Gallus gallus ). För att e

Befolkningsstruktur för flundra (Platichthys flesus) i Östersjön: skillnader mellan botten- och pelagiska gyttare

Befolkningsstruktur för flundra (Platichthys flesus) i Östersjön: skillnader mellan botten- och pelagiska gyttare

Abstrakt Vi hittade en betydande befolkningsstruktur och isolering på avstånd mellan prover av flundra ( Platichthys flesus ) i Östersjön, Kattegat och Skagerrak med hjälp av genetiska markörer för mikrosatellit. Detta mönster berodde nästan helt på en skillnad mellan flödet som har demersalt gytning i norra Östersjön, jämfört med pelagiska gyttare i södra Östersjön och på västkusten i Sverige. Bland demersal spa

Uppskattning av överskridningshastigheter i hierarkiska nivåer av frukt, individer, populationer och arter i Magnolia stellata

Uppskattning av överskridningshastigheter i hierarkiska nivåer av frukt, individer, populationer och arter i Magnolia stellata

Abstrakt I växtarter med blandat parningssystem orsakar skillnader i olika faktorer - inklusive deras pollineringssystem, blommande fenologi, livsform och mottaglighet för inavelsdepression - variationer i utbredningshastigheter bland frukter inom individer, bland individer inom populationer och bland populationer inom arter.

Genetisk reinkarnation av arbetare som drottningar i den östra honungbiet Apis cerana

Genetisk reinkarnation av arbetare som drottningar i den östra honungbiet Apis cerana

ämnen Social utveckling Abstrakt Telytokös parthenogenes, eller den asexuella produktionen av kvinnliga avkommor, är sällsynt i djurriket, men relativt vanligt i sociala Hymenoptera. I honungsbin är det emellertid endast känt att det finns allestädes närvarande i en underart av Apis mellifera , Cape honungsbin, A. mellif

Speciation bromsar i utbredda och långt levande trädskatter: insikter från den tropiska timmerträdet släktet Milicia (Moraceae)

Speciation bromsar i utbredda och långt levande trädskatter: insikter från den tropiska timmerträdet släktet Milicia (Moraceae)

ämnen Phylogenetics Växtgenetik speciation Abstrakt Den långa generationstiden och den stora effektiva storleken på utbredda skogsträdarter kan resultera i långsam utvecklingshastighet och ofullständig sortering av linjer, vilket komplicerar artens avgränsning. Vi behandlade denna fråga med det afrikanska timmerträdet släktet Milicia som består av två morfologiskt likartade och ofta förvirrade arter: M. excelsa , ut

Rekonstruera sjukdomsutbrott från genetiska data: en grafinriktning

Rekonstruera sjukdomsutbrott från genetiska data: en grafinriktning

ämnen Epidemiologi för infektionssjukdomar Phylogenetics Abstrakt Epidemiologi och folkhälsoplanering kommer alltmer att förlita sig på analysen av genetiska sekvensdata. I synnerhet kan genetiska data kombinerade med datum och platser för provtagna isolat användas för att rekonstruera spatiotemporal dynamik hos patogener under utbrott. Hittil

Multigenerational hybridisering och dess konsekvenser för modereffekter hos atlantisk lax

Multigenerational hybridisering och dess konsekvenser för modereffekter hos atlantisk lax

ämnen Djuravel Genetisk hybridisering Abstrakt Utbredning mellan segregerande populationer kan vara viktigt ur ett evolutionärt, bevarande- och ekonomiskt-jordbruksperspektiv. Huruvida och hur utavel påverkar moder effekter i vilda populationer har sällan studerats, trots både det framträdande moder inflytandet på överlevnad av tidigt avkomma och den kända förekomsten av konditioneffekter till följd av utavel i många taxa. Vi studera

Plio-Pleistocenhistoria och fylogeografi av Acacia senegal i torra skogar och savanner i tropiskt Afrika söder om Sahara: bevis på tidig kolonisering och ny utvidgning av intervallet

Plio-Pleistocenhistoria och fylogeografi av Acacia senegal i torra skogar och savanner i tropiskt Afrika söder om Sahara: bevis på tidig kolonisering och ny utvidgning av intervallet

ämnen Genetisk variation Phylogenetics Växtgenetik Abstrakt Torra områden är omfattande över Afrika söder om Sahara, socioekonomiskt och ekologiskt viktiga men ändå mycket känsliga för miljöförändringar. Evolutionär historia, som avslöjats av modern intraspecifik genetisk variation, kan ge värdefull insikt i hur arter har reagerat på tidigare miljö- och befolkningsförändringar och vägleda strategier för att främja motståndskraft mot framtida förändringar. Gummi arabiskt träd (Aca

Länkar transkriptomisk och genomisk variation till tillväxt i bäckrörhybrider (Salvelinus fontinalis, Mitchill)

Länkar transkriptomisk och genomisk variation till tillväxt i bäckrörhybrider (Salvelinus fontinalis, Mitchill)

ämnen Genetisk hybridisering Genetisk variation Befolkningsgenetik transkriptomik Abstrakt Hybridisering kan leda till fenotypiska skillnader som härrör från förändringar i genuttrycksmönster eller nya allelkombinationer. Variationen i genuttryck tros styras av skillnader i transkriptionsreglering av föräldraalleler, antingen genom cis- eller transreglerande element. En tidi

Spår av medeltida migrationer i en socialt stratifierad befolkning från norra Italien. Bevis från uniparentala markörer och djupt rotade stamtavlor

Spår av medeltida migrationer i en socialt stratifierad befolkning från norra Italien. Bevis från uniparentala markörer och djupt rotade stamtavlor

ämnen Kulturell utveckling Genetiska markörer Befolkningsdynamik Befolkningsgenetik Abstrakt Sociala och kulturella faktorer spelade en avgörande roll för att fastställa Europas genetiska struktur. Därför kan socialt lagdelade populationer hjälpa till att fokusera på specifika avsnitt av europeisk demografisk historia. I denna

Avkryptering av finstrukturen för stamblandning i den beduinska befolkningen med hjälp av genomiska data

Avkryptering av finstrukturen för stamblandning i den beduinska befolkningen med hjälp av genomiska data

ämnen Befolkningsgenetik Abstrakt Den israeliska beduininbefolkningen är mycket inavlade och strukturerad med en mycket hög förekomst av recessiva sjukdomar. Många studier under de senaste två decennierna inriktade sig på kopplingsanalys i stora, flera konsanguenta stamtavlor av denna befolkning. Tillk

Är homoploid hybridspecifikation så sällsynt? En empiriker syn

Är homoploid hybridspecifikation så sällsynt? En empiriker syn

ämnen Evolution Evolutionär teori Phylogenetics Naturlig hybridisering och dess roll i evolutionen och specifikt för att skapa ny mångfald är ett gammalt och ändå oändligt nytt liv (Lotsy, 1916; Anderson, 1949; Stebbins, 1959; Rieseberg et al., 2003; Mallet, 2007; Soltis och Soltis, 2009 ; Larsen et al., 2010;

Genetisk struktur för en grundart: skalning av samhällsfenotyper från individen till regionen

Genetisk struktur för en grundart: skalning av samhällsfenotyper från individen till regionen

Abstrakt Att förstå de lokala och regionala mönstren för artsfördelning har varit ett huvudmål för ekologisk och evolutionär forskning. Uppfattningen att dessa mönster kan förstås genom enkla kvantitativa regler är attraktiv, men även om det finns många skalningslagar (t.ex. metabola, fraktaler), är vi medvetna om inga studier som har placerat enskilda egenskaper och samhällsstruktur i ett genetiskt baserat skalningsram . Vi dokumentera

Genetisk mångfald och genflöde minskar med förhöjning i montanflodor

Genetisk mångfald och genflöde minskar med förhöjning i montanflodor

ämnen Ekologisk genetik Befolkningsgenetik Abstrakt Montane-miljöer runt om i världen är "hotspots" för biologisk mångfald och viktiga reservoarer av genetisk mångfald. Montanarter är också vanligtvis mer sårbara för miljöförändringar än deras motsvarigheter med låg höjd på grund av begränsade intervall och spridningsbegränsningar. Här fokuserar vi p

Genetiska och fenotypiska påverkningar på överlevnad av kopuleringspropp hos möss

Genetiska och fenotypiska påverkningar på överlevnad av kopuleringspropp hos möss

ämnen Evolutionär biologi Abstrakt Över en mångfald av djur koagulerar manlig seminalvätska vid utlösning för att bilda en härdad struktur känd som en kopulatorisk plugg. Tidigare studier tyder på att copulatory pluggar utvecklats som en mekanism för män att hindra rematering av kvinnor, men detaljerade undersökningar av den tidsförlopp som pluggar överlever i kvinnans reproduktiva kanal saknas. Här korsar vi

Geninteraktioner begränsar utvecklingen av fosfinresistens i den mindre kornborraren, Rhyzopertha dominica

Geninteraktioner begränsar utvecklingen av fosfinresistens i den mindre kornborraren, Rhyzopertha dominica

Abstrakt Fosfin, ett allmänt använt rökmedel för att skydda lagrat spannmål från insektsskadedjur, dödar organismer indirekt genom att inducera oxidativ stress. Höga nivåer av ärftlig motståndskraft mot fosfin i insekts skadedjur av lagrat spannmål, Rhyzopertha dominica har detekterats i Asien, Australien och Sydamerika. För att fö

Kortsiktiga genetiska konsekvenser av förlust av livsmiljöer och fragmentering för den neotropiska palm Oenocarpus bataua

Kortsiktiga genetiska konsekvenser av förlust av livsmiljöer och fragmentering för den neotropiska palm Oenocarpus bataua

ämnen Strukturell variation Abstrakt Habitatförlust och fragmentering kan påverka djurmedierad spridning av utsäde och pollen, och en viktig fråga är hur de genetiska egenskaperna hos växtpopulationer svarar på dessa förändringar. Teorin förutspår att den genetiska mångfalden kan vara mindre känslig för sådana störningar på kort sikt, medan inavel och genetisk struktur kan reagera starkare. Resultaten från

Genomiken för inkompatibilitetsfaktorer och könsbestämning i hybridiserande arter av Cottus (Fiskarna)

Genomiken för inkompatibilitetsfaktorer och könsbestämning i hybridiserande arter av Cottus (Fiskarna)

ämnen Genomics Befolkningsgenetik Abstrakt Cottus rhenanus och Cottus perifretum har bildat hybridlinjer och smala hybridzoner som bäst kan förklaras genom verkan av naturligt urval. Emellertid är de underliggande selektiva krafterna såväl som deras genomiska mål inte väl förståda. Denna studie identifierar genomiska regioner i föräldrarna som orsakar hybridkompatibilitet och testar om dessa manifesteras på ett könsspecifikt sätt för att lära sig om processer som påverkar naturlig hybridisering i Cottus . Interspecifika F

Svar på selektion och insåg ärftlighet hos spermlängden i den gula gungflugan (Scathophaga stercoraria)

Svar på selektion och insåg ärftlighet hos spermlängden i den gula gungflugan (Scathophaga stercoraria)

Abstrakt Spermlängden visar betydande fenotypisk variation både inter- och intra-specifikt, men en allmän förklaring till denna variation saknas. Dessutom är vår förståelse för den genetiska variationen som ligger bakom variationen i spermalängden också begränsad eftersom det har funnits få studier om genetik för spermier. En faktor so

Lagerförbättring eller havsranching? Insikter från att övervaka den genetiska mångfalden, besläktningen och effektiva befolkningsstorleken i en sådd stor kammusselspopulation (Pecten maximus)

Lagerförbättring eller havsranching? Insikter från att övervaka den genetiska mångfalden, besläktningen och effektiva befolkningsstorleken i en sådd stor kammusselspopulation (Pecten maximus)

ämnen Biologisk mångfald Befolkningsgenetik Abstrakt Massfrigöringen av kläckningsförökade bestånd väcker många frågor om dess effektivitet när det gäller lokal rekrytering och effekt på den genetiska mångfalden i vilda populationer. Ett utsädesprogram, bestående av massfrisläppande av kläckproducerade ungar i den lokala naturligt förekommande populationen av stora kammusslor ( Pecten maximus L.), inleddes i börj

Transkription av de 5S rRNA heterokromatiska generna kontrolleras epigenetiskt i Arabidopsis thaliana och Xenopus laevis

Transkription av de 5S rRNA heterokromatiska generna kontrolleras epigenetiskt i Arabidopsis thaliana och Xenopus laevis

Abstrakt 5S ribosomalt DNA är en mycket konserverad tandemiskt upprepad multigenisk familj. Som föreslagits under lång tid har vi visat att endast en bråkdel av 5S rRNA-generna uttrycks i Arabidopsis thaliana. I Xenopus laevis finns det en utvecklingskontroll av expressionen av 5S rRNA-generna med endast en av de två 5S rDNA-familjerna uttryckta under oogenes. För

Utmanar kläckvuxna havsborre ett hot mot den genetiska mångfalden i vilda populationer?

Utmanar kläckvuxna havsborre ett hot mot den genetiska mångfalden i vilda populationer?

ämnen Djuravel Befolkningsgenetik Abstrakt Hos laxfiskar har det visat sig att frisättningen av kläckfiskfödda fiskar orsakar irreversibla genetiska effekter på vilda populationer. Även om ansvarsfulla metoder för att producera och släppa genetiskt olika, kläckningsuppfödda juveniler har publicerats i stor utsträckning, implementeras de sällan. Här unders

Effekter av spridningsplastisitet på befolkningsdivergens och speciation

Effekter av spridningsplastisitet på befolkningsdivergens och speciation

ämnen Evolutionär teori Strukturell variation Abstrakt Fenotypisk plasticitet tros ha en roll för att driva befolkningsetablering, lokal anpassning och specifikation. Emellertid har spridningsplastisitet undervärderats i denna litteratur. Plastisiteten i beslutet att sprida är taxonomiskt utbredd och jag ger exempel på insekter, blötdjur, polychaetes, ryggradsdjur och blommande växter. Det te

Negativa fenotypiska och genetiska samband mellan kopulationsvaraktighet och livslängd hos hanfröbaggar

Negativa fenotypiska och genetiska samband mellan kopulationsvaraktighet och livslängd hos hanfröbaggar

ämnen Genetisk föreningsstudie Modell ryggradslösa djur Sexuellt beteende Den ursprungliga artikeln publicerades den 29 juli 2009 Rättelse till : Heredity (2009) 103, 340–345; doi: 10, 1038 / hdy.2009.80 Författarna har upptäckt ett fel de vill korrigera. Tabell 1 visar felaktiga värden för koefficienterna för additiv genetisk variation (CV A ). Rätta vär

Inavelsdepression i stadsmiljöer i fågelboets svamp Cyathus stercoreus (Nidulariaceae: Basidiomycota)

Inavelsdepression i stadsmiljöer i fågelboets svamp Cyathus stercoreus (Nidulariaceae: Basidiomycota)

ämnen svampar Inavel Befolkningsgenetik Abstrakt Många organismer visar codispersal av avkommor, men färre visar codispersal av kompatibla gameter. Denna mekanism förbättrar förmågan hos en art att kolonisera efter långdistansspridning som en mekanism för reproduktiv försäkring, men den främjar också inavel och potentiell minskning av konditionen. Här undersö

Effektivitet av genomiskt urval för avelspopulation och fenotypförutsägelse i tomat

Effektivitet av genomiskt urval för avelspopulation och fenotypförutsägelse i tomat

ämnen Jordbruksgenetik Växtuppfödning Växtgenetik Abstrakt Genomiskt urval (GS), som använder uppskattad genetisk potential baserat på genomomfattande genotypdata för ett avelsval, accepteras nu allmänt som en effektiv metod för att förbättra genetiskt komplexa egenskaper. Vi bedömde GS: s potential att öka halten av lösligt fast material och tomatens totala fruktvikt. En samling a

Evolutionär och ekologisk funktionell genomik

Evolutionär och ekologisk funktionell genomik

Genomik, proteomik och relaterad teknik upptäcker anmärkningsvärd variation i gener och deras uttryck, men dessa upptäckter är bara en början. Nästa steg är att upptäcka hur denna variation påverkar funktionen och konditionen för hela organismer i populationer. Vid sidan av de väl etablerade samhällena inom biomedicinsk och jordbruksfunktionell genomik har ett nytt samhälle bildats: evolutionär och ekologisk funktionell genomik (EEFG), som försöker förstå den funktionella grunden för evolutionära krafter som utformar ekologiskt viktiga egenskaper i naturliga biologiska samhällen. Detta kräver a

Förstå den senaste koloniseringshistoriken för en växtpatogen svamp med hjälp av populationsgenetiska verktyg och Approximate Bayesian Computation

Förstå den senaste koloniseringshistoriken för en växtpatogen svamp med hjälp av populationsgenetiska verktyg och Approximate Bayesian Computation

ämnen Svampbiologi Svamppatogenes Befolkningsgenetik Abstrakt Att förstå de processer som nya sjukdomar introduceras i tidigare friska områden är av stort intresse för att utarbeta förebyggande och hanteringspolitiken, liksom för att förstå dynamiken i patogenmångfald i stor rumslig skala. I denna s

Transkriptombredd signatur av hybridnedbrytning förknippad med inre reproduktionsisolering i parvis av fiskfiskar (Coregonus spp. Salmonidae)

Transkriptombredd signatur av hybridnedbrytning förknippad med inre reproduktionsisolering i parvis av fiskfiskar (Coregonus spp. Salmonidae)

ämnen Utvecklingsbiologi Genreglering Modella ryggradsdjur speciation Abstrakt Genetiska analyser av speciation har nästan uteslutande fokuserat på retrospektiva analyser av reproduktiv isolering mellan mycket divergerande arter. Ändå måste en fullständig förståelse av specifikationsprocessen omfatta analys av konsekvenserna av genomisk divergens i unga linjer som fortfarande kan utbyta gener under naturliga förhållanden. Uppsamlin

Förädlingsbelastning och rensning: konsekvenser för kortvarig överlevnad och bevarande av små populationer

Förädlingsbelastning och rensning: konsekvenser för kortvarig överlevnad och bevarande av små populationer

ämnen Inavel Befolkningsgenetik Abstrakt Med hjälp av datorsimuleringar utvärderar vi effekterna av genetisk rensning av inavlingsbelastning i små populationer, med antagande av genetiska modeller av skadliga mutationer som står för den typiska mängden belastning empiriskt observerad. Våra resultat visar att genetisk rensning effektivt avlägsnar inavlingsbelastningen för både dödliga och icke-dödliga mutationer, vilket minskar mängden inavelsdepression i förhållande till det som förväntas utan val. Vi finner att de

Ontogenetiska förändringar i genetiska varianter av åldersberoende plasticitet längs en latitudinal gradient

Ontogenetiska förändringar i genetiska varianter av åldersberoende plasticitet längs en latitudinal gradient

ämnen Evolutionsgenetik Abstrakt Uttrycket av fenotypisk plasticitet kan skilja sig mellan livsfaserna i samma organisme. Åldersberoende plasticitet kan vara viktigt för anpassning till heterogena miljöer, men detta har först nyligen erkänts. Huruvida åldersberoende plasticitet är ett vanligt resultat av lokal anpassning och om populationer har genetisk variation i detta avseende är i stort sett okänt. För att

Relativa effekter av segregering och rekombination på utvecklingen av kön i ändliga diploida populationer

Relativa effekter av segregering och rekombination på utvecklingen av kön i ändliga diploida populationer

ämnen Evolutionsgenetik Abstrakt Mekanismen för att reproducera mer livskraftiga avkommor som svar på urval är en viktig faktor som påverkar fördelarna med sex. I diploider kombinerar sexuell reproduktion genotyp genom rekombination och segregering. Teoretiska studier av sexuell reproduktion har undersökt fördelen med rekombination hos haploider. Emelle

Förutsäga rishybridprestanda med univariata och multivariata GBLUP-modeller baserade på North Carolina parningsdesign II

Förutsäga rishybridprestanda med univariata och multivariata GBLUP-modeller baserade på North Carolina parningsdesign II

ämnen Växtuppfödning Abstrakt Genomiskt urval (GS) är effektivare än traditionella fenotypbaserade metoder i hybridavel. Föreliggande studie undersökte förutsägelseförmågan hos genomiska bästa linjära opartiska förutsägelsemodeller för rishybrider baserade på North Carolina parningsdesign II, där totalt 115 inavlade rislinjer korsades med 5 manliga sterila linjer. Med hjälp av ått

Inferens av multipelvågspopulation blandning genom att modellera sönderfall av kopplingsdifferens med polynomfunktioner

Inferens av multipelvågspopulation blandning genom att modellera sönderfall av kopplingsdifferens med polynomfunktioner

ämnen Befolkningsgenetik Abstrakt För att dra slutsatser om populationsblandning är en viktig utmaning med metoder baserade på blandningskopplingsjämvikten (ALD) att ta bort effekten av källa LD (SLD), som ärvs direkt från källpopulationerna. I tidigare metoder anordnades endast sönderfallskurvan för viktad LD mellan par av platser vars genetiska avstånd var större än ett visst startavstånd av enstaka eller flera exponentiella funktioner för inferensen av nyligen en- eller flervågsblandning. Effekten av SLD

Befolkningskluster och klonstruktur bevisar reliktillståndet Ulmus minor Mill. på Balearerna

Befolkningskluster och klonstruktur bevisar reliktillståndet Ulmus minor Mill. på Balearerna

ämnen Bevarande biologi Växtekologi Befolkningsgenetik Abstrakt Fältelm ( Ulmus minor ) är ett riparianträd som växer i sällsynta, små populationer spridda längs tillfälliga vattendrag på Balearerna, numera mest täckta med medelhavsvegetation. Jordbruk och jordbruk på den bördiga marken längs de periodvis översvämmade slätterna har minskat almpopulationerna till glesa trädlinjer längs bäcken. Förekomsten av fält

En bedömning av tillförlitligheten hos kvantitativa genetiska uppskattningar i studiesystem med hög grad av reproduktion av extra par och låg rekrytering

En bedömning av tillförlitligheten hos kvantitativa genetiska uppskattningar i studiesystem med hög grad av reproduktion av extra par och låg rekrytering

ämnen Evolutionsgenetik Abstrakt Kvantitativa metoder för genetik, och särskilt djurmodeller, används i stor utsträckning för att bedöma den genetiska (sam) variationen av viktiga konditionskriterier och sluta anpassningsförmågan hos vilda populationer. Trots vikten av precision och noggrannhet i uppskattningar av genetisk varians och deras potentiella känslighet för olika ekologiska och populationsspecifika faktorer testas deras sällsynthet sällan uttryckligen. Här använde

Kartlägga genetiska loci som interagerar med myostatin för att påverka tillväxtegenskaper

Kartlägga genetiska loci som interagerar med myostatin för att påverka tillväxtegenskaper

ämnen Genetisk kartläggning Kvantitativa drag loci Abstrakt Myostatin, eller GDF8, är en hämmare av skelettmuskeltillväxt. En icke-funktionell myostatinmutation leder till en dubbel muskulös fenotyp i vissa arter, till exempel möss, nötkreatur och människor. Tidigare studier har visat att det finns loci i genomet som interagerar med myostatin för att kontrollera djupfettdjup och andra komplexa egenskaper. Vi rappo

Öar med speciation eller mirages i öknen? Att undersöka rollen som begränsad rekombination för att upprätthålla arter

Öar med speciation eller mirages i öknen? Att undersöka rollen som begränsad rekombination för att upprätthålla arter

ämnen DNA-rekombination speciation Den ursprungliga artikeln publicerades den 18 november 2009 Rättelse till: Heredity (2009) 103 , 434–444; doi: 10, 1038 / hdy2009.151 Sedan publiceringen av detta dokument har författarna lagt märke till att de inkluderade ett citat till Turner et al. (2005) på sidan 440, och sedan sade på sidan 441 'var och en av de empiriska studierna som nämns ovan specifikt dokumenterade detta mönster åtminstone delvis med hjälp av relativa divergensåtgärder såsom F ST och Da och tolkade i samband med regioner med låg rekombination som underlättar arter avviker i närva

Genetiska varianskomponenter och ärftlighet av multiallelisk heterozygositet under inavel

Genetiska varianskomponenter och ärftlighet av multiallelisk heterozygositet under inavel

ämnen Evolutionsgenetik Abstrakt Bibehållandet av den genetiska mångfalden i fitnessrelaterade egenskaper är fortfarande ett centralt ämne i evolutionär biologi, till exempel i samband med sexuell selektion för genetiska fördelar. Bland de lösningar som har föreslagits är riktad sexuell selektion för heterozygositet. Betydelsen

Fortplantningsaktivitet utlöser accelererad manlig dödlighet och minskar livslängden: genetiska och genetiska uttrycksdeterminanter i Drosophila

Fortplantningsaktivitet utlöser accelererad manlig dödlighet och minskar livslängden: genetiska och genetiska uttrycksdeterminanter i Drosophila

ämnen Evolutionsgenetik Genetik Abstrakt Reproduktion och åldrande utvecklades till att vara intimt förknippade. Experimentellt urval för reproduktion av tidigt liv driver utvecklingen av minskad livslängd i Drosophila medan experimentell selektion för ökad livslängd leder till förändringar i reproduktionen. Även om

Förädlingsdepression i dioecious populationer av växten Mercurialis annua: jämförelser mellan utkorsad avkomma och avkomman från självgödslade feminiserade män

Förädlingsdepression i dioecious populationer av växten Mercurialis annua: jämförelser mellan utkorsad avkomma och avkomman från självgödslade feminiserade män

Abstrakt Inavelsdepression är en nyckelfaktor för att upprätthålla separata kön i växter genom val för att undvika självgödsling. Men mycket lite är känt om nivåerna av inavelsdepression hos dioecious arter, uppenbarligen för att det är svårt att själv befrukta män eller kvinnor. Vi övervann detta problem genom att klonalt föröka män från linjer i en dioecious metapopulation av den europeiska årliga växten Mercurialis annua , feminisera några av dem och korsa feminiserade med de oförminskade klonerna. Med hjälp av denna metod

Hur fet är svansen?

Hur fet är svansen?

Frö- och pollenfördelningar är viktiga parametrar för att forma dynamiken och utvecklingen av växtpopulationer, eftersom de påverkar både koloniseringsprocesser och genetiska utbyten mellan individer. Vår kunskap om avståndet mellan frön eller pollen har förbättrats kraftigt under de senaste två decennierna genom att använda mycket polymorfa molekylära markörer, såsom mikrosatelliter (Smouse och Sork, 2004). Genom att match

Flera introduktioner av divergerande genetiska linjer i en invasiv svamppatogen, Cryphonectria parasitica, i Frankrike

Flera introduktioner av divergerande genetiska linjer i en invasiv svamppatogen, Cryphonectria parasitica, i Frankrike

Abstrakt Förekomsten av flera introduktioner kan vara en avgörande faktor för framgångsrik etablering av invasiva arter, men få studier fokuserar på införandet av svamppatogener, trots deras betydande effekt på invaderade livsmiljöer. Trots att Cryphonectria parasitica , svampen med kastanjeblås som introducerades i Nordamerika och Europa från Asien under 1900-talet, orsakade dramatiska förändringar i dess nya sortiment, är dess historia inte introducerad i Europa. Med hjälp av

Evolutionsstudie av en potentiell selektionsmålregion hos grisen

Evolutionsstudie av en potentiell selektionsmålregion hos grisen

ämnen Genetisk variation Modella ryggradsdjur Molekylär evolution Kvantitativa drag loci Abstrakt Domestisering, modern uppfödning och konstgjord urval har dramatiskt utformat den genomiska variationen hos husdjur. I boskap var den så kallade FAT1 kvantitativa drag locus (QTL) i svinkromosom 4 den första QTL som avslöjades, även om dess exakta molekylära natur har förblivit svårfångad. Här karak

Uppskattning av samtida effektiv befolkningsstorlek i icke-modellarter med kopplingsdifferens mellan tusentals loci

Uppskattning av samtida effektiv befolkningsstorlek i icke-modellarter med kopplingsdifferens mellan tusentals loci

ämnen Genetisk variation Genomics Befolkningsgenetik Abstrakt Samtidig effektiv befolkningsstorlek ( N e ) kan uppskattas med användning av kopplingsdifferens (LD) som observeras över par av loci som antas vara selektivt neutrala och obundna. Denna metod har vanligtvis använts för datamängder som innehåller 10–100 loci för att informera bevarande och studera befolkningsdemografi. Prestand

Filylografiska bevis för två mesiska refugier i en hotspot för biologisk mångfald

Filylografiska bevis för två mesiska refugier i en hotspot för biologisk mångfald

ämnen Biologisk mångfald biogeography Växtgenetik Befolkningsgenetik Abstrakt Fylogeografiska studier av flora i artsrika sydvästra Australien pekar på komplexa evolutionära historier, vilket återspeglar mönster av uthållighet och motståndskraft mot klimatförändringar under Pleistocen. Vi frågade om kustområden i Mellanväst och söder, samt granitutbrott och inlandsområden, har fungerat som stora refugier inom denna region under klimatförändringar i Pleistocen genom att analysera fylogeografiska mönster i busken Calothamnus quadrifidus R.Br. (Myrtaceae). Vi

Adaptiv divergens i en hög genflödesmiljö: Hsc70-variation i den europeiska flundren (Platichthys flesus L.)

Adaptiv divergens i en hög genflödesmiljö: Hsc70-variation i den europeiska flundren (Platichthys flesus L.)

Abstrakt Lite är känt om lokala anpassningar hos marina fiskar eftersom genetiska undersökningar av befolkningen i dessa arter normalt inte har använt genetiska markörer som är utvalda. I den här studien använde vi en kandidatgen-strategi för att undersöka adaptiv befolkningsdivergens i den europeiska flundren ( Platichthys flesus L.) i hela

Inavlade dekorerade syrsor uppvisar högre mått på makroparasitisk immunitet än utavlägsna individer

Inavlade dekorerade syrsor uppvisar högre mått på makroparasitisk immunitet än utavlägsna individer

ämnen Genetik Immunologi Inavel Abstrakt Inavel antas ha negativa effekter på konditionen, inklusive den minskade förmågan att motstå immunutmaningar. Vi undersökte de immunologiska konsekvenserna av inavel i dekorerade syrsor, Gryllodes sigillatus , genom att jämföra lytisk aktivitet, fenoloxidas (PO) -aktivitet och kapacitetsförmåga hos syrsor från åtta inavlade linjer med den för syrsor från den utavlägsna grundarpopulationen. Överraskande

Användning av flera markörer visar en kryptisk västlig refugium och postglacial koloniseringsvägar för atlantisk lax (Salmo salar L.) i nordvästra Europa

Användning av flera markörer visar en kryptisk västlig refugium och postglacial koloniseringsvägar för atlantisk lax (Salmo salar L.) i nordvästra Europa

ämnen Genetiska markörer Genetisk variation Abstrakt Glaciala och postglaciala processer är kända för att vara viktiga faktorer för samtida populationsstrukturering för många arter. I Europa tros refugier i de italienska, balkaniska och iberiska halvöerna vara de viktigaste källorna till arter som koloniserar norra Europa efter den glaciala reträtten; emellertid finns det ökande bevis på små, kryptiska refugier som finns norr om dessa för många kalltoleranta arter. Denna studie u

Heterozygotbrister i parasitpopulationer: en utvärdering av inbördes relaterade hypoteser i tvättbjörnfästingen, Ixodes texanus

Heterozygotbrister i parasitpopulationer: en utvärdering av inbördes relaterade hypoteser i tvättbjörnfästingen, Ixodes texanus

ämnen Modell ryggradslösa djur Parasitbiologi Befolkningsgenetik Abstrakt Befolkningsgenetik används i allt högre grad för att studera biologin hos parasiter i vågen för både värden (infrapopulation, IP) och värdpopulationen (komponentpopulation, CP). I denna studie testade vi tre mekanistiska hypoteser som kunde förklara avvikelser från Hardy – Weinberg-jämviktsförväntningarna (HWE) på grund av heterozygotunderskott (HD) på CP-skalan i tvättbjörnsfästingar ( Ixodes texanus ; n = 718) samlade från tvättbjörnar ( Procyon lotor ; n = 91) och genotypade vid 11 mikrosatellite loci. Dessa hypoteser

Genomisk intryck: teorier och data

Genomisk intryck: teorier och data

ämnen imprinting William Bateson, en av fäderna till Mendelian genetik, förmanade i sin initierande professorföreläsning i Cambridge studenter till den nya vetenskapen: Om jag får släppa ett råd till nybörjare är det: Skatt dina undantag! . Håll dem alltid avslöjade och i sikte. Undantag är som det grova tegelverket i en växande byggnad som säger att det finns mer att komma och visar var nästa konstruktion ska vara. (Bateson, 1908

Förändringar i fitnessassocierade drag beroende på stapling av transgen glyfosatresistens och insektsresistens i Brassica napus L.

Förändringar i fitnessassocierade drag beroende på stapling av transgen glyfosatresistens och insektsresistens i Brassica napus L.

ämnen Jordbruksgenetik Växtekologi Växtspänningssvar Abstrakt I allt högre grad utvecklas genetiskt modifierade grödor för att uttrycka flera "staplade" egenskaper för olika typer av transgener, till exempel herbicidresistens, insektsbeständighet, grödskvalitet och tolerans mot miljöspänningar. Frigöring

Hela genomens sekvensering av icke-modellorganismer: lärdomar från obekräftade läsningar

Hela genomens sekvensering av icke-modellorganismer: lärdomar från obekräftade läsningar

ämnen Genetisk kartläggning Nästa generations sekvensering Växtgenetik Abstrakt Omotiverade läsningar kasseras ofta från analysen av hela genom-sekvensering, men ny biologisk information och insikter kan avslöjas genom deras analys. I det här dokumentet undersöker vi omotiverade läsningar från re-sekvenseringsdata för 33 ärt bladlössgenom från individer specialiserade på olika värdväxter. De icke-mappade

Ökad inavel och stark släktskapsstruktur i Taxus baccata uppskattad från både AFLP och SSR-data

Ökad inavel och stark släktskapsstruktur i Taxus baccata uppskattad från både AFLP och SSR-data

ämnen Inavel Naturlig variation i växter Befolkningsgenetik Abstrakt Habitatfragmentering kan ha allvarliga genetiska konsekvenser för träd, såsom ökad inavel och minskad effektiv befolkningsstorlek. I själva verket lider lokala populationer av minskad genetisk variation och därmed förlust av anpassningsförmåga, vilket följaktligen ökar deras risk för utrotning. I Europa är

Effektiv befolkningsstorlek inom ekologi och evolution

Effektiv befolkningsstorlek inom ekologi och evolution

ämnen Evolutionär teori Befolkningsdynamik Befolkningsgenetik Effektiv populationstorlek ( N e ) är en av de viktigaste parametrarna inom populationsgenetik och bevarandebiologi. Det översätter folkräkningsstorlekar för en verklig population till storleken på en idealiserad population som visar samma förlustgrad av genetisk mångfald som den verkliga befolkningen som studeras. Flera ko

Den fylogeografiska mönstret för utvidgning av intervall ger bevis för kryptiska arter i Silene nutans i Västeuropa

Den fylogeografiska mönstret för utvidgning av intervall ger bevis för kryptiska arter i Silene nutans i Västeuropa

ämnen Ekologi Befolkningsgenetik Abstrakt Som ett resultat av nyare eller tidigare evolutionära processer kan en enda art bestå av distinkta evolutionsenheter (ESU), till och med motsvarande kryptiska arter. För att fastställa de underliggande mekanismerna för intervallskift och processerna i arbetet vid uppbyggnaden av olika ESU: er måste det klarläggas de faktorer som bidrar till genetisk avvikelse från befolkningen över en art. Vi under

Kromosombredd kopplingsjämvikt orsakad av en inversionspolymorfism i den vita strupen (Zonotrichia albicollis)

Kromosombredd kopplingsjämvikt orsakad av en inversionspolymorfism i den vita strupen (Zonotrichia albicollis)

ämnen Genetisk variation Modella ryggradsdjur Molekylär evolution Abstrakt Kromosomala inversioner har varit av långvarigt intresse för genetiker eftersom de kan undertrycka rekombination och underlätta bildandet av adaptiva genkomplex. En exceptionell inversionspolymorfism (ZAL2 m ) i den vita strupen ( Zonotrichia albicollis ) är kopplad till variation i fjäderdräkt, socialt beteende och parval, och upprätthålls i befolkningen genom negativ assortativ parning. ZAL2 m-

Befolkningsdynamik och snabb spridning av Cardinium, en bakteriell endosymbiont som orsakar cytoplasmisk inkompatibilitet i Encarsia pergandiella (Hymenoptera: Aphelinidae)

Befolkningsdynamik och snabb spridning av Cardinium, en bakteriell endosymbiont som orsakar cytoplasmisk inkompatibilitet i Encarsia pergandiella (Hymenoptera: Aphelinidae)

Abstrakt Cytoplasmatisk inkompatibilitet (CI) är en vanlig fenotyp av maternellt ärvda bakteriella symboler av leddjur; I sitt enklaste uttryck producerar oinfekterade kvinnor få eller inga livskraftiga avkommor när de paras till infekterade män. Infekterade kvinnor upplever således en reproduktiv fördel relativt den hos oinfekterade kvinnor, med potentialen för att symbionten sprider sig snabbt. CI-bef

Förflyttbara element i däggdjursgränsen: en bekväm nisch eller en dödlig fälla?

Förflyttbara element i däggdjursgränsen: en bekväm nisch eller en dödlig fälla?

ämnen DNA-metylering DNA transponerbara element Germline-utveckling Piwi-RNA Abstrakt Retrotransponerbara element utgör cirka 50% av däggdjursgenomet. Deras aktivitet utgör ett ständigt hot mot värden och har lett till utvecklingen av anpassningsbara kontrollmekanismer för att skydda genomarkitektur och funktion. För a

Jordbrukare utan gränser - genetisk strukturering i sekelgammalt korn (Hordeum vulgare)

Jordbrukare utan gränser - genetisk strukturering i sekelgammalt korn (Hordeum vulgare)

ämnen Jordbruksgenetik biogeography Befolkningsgenetik Abstrakt Den geografiska spridningen av den genetiska mångfalden kan avslöja en arts evolutionära historia. För grödväxter indikerar fylogeografiska mönster också hur utsäde har utbytts och spridits i jordbrukssamhällen. Sådana mönster är emellertid lätt suddiga av den intensiva fröhandeln, växtförbättring och till och med bevarandet av bankrörelser under det tjugonde århundradet, och det är därför särskilt utmanande att urskilja finskala filogoografiska mönster. Med hjälp av historiska