Europeisk tidskrift för mänsklig genetik (April 2020)

Genetisk undersökning av FOXO3A kräver särskild uppmärksamhet på grund av sekvenshomologi med FOXO3B

Genetisk undersökning av FOXO3A kräver särskild uppmärksamhet på grund av sekvenshomologi med FOXO3B

ämnen Genetisk variation Transkriptionsfaktorer Abstrakt Vår studie visar att den genetiska undersökningen av gaffelhuvud O3A-genen ( FOXO3A ), en validerad mänsklig livslängdsgen, hindras starkt av det faktum att dess exoniska regioner har 99% sekvenshomologi med FOXO3B- pseudogenen. Om det inte beaktas kan denna höga grad av homologi orsaka allvarliga genotypnings- eller sekvensfel. Här

Riktlinjer för diagnostisk nästa generations sekvensering

Riktlinjer för diagnostisk nästa generations sekvensering

ämnen Diagnos Nästa generations sekvensering Politik Den ursprungliga artikeln publicerades den 28 oktober 2015 Rättelse till: European Journal of Human Genetics (2016) 24 , 2–5; doi: 10, 1038 / ejhg.2015.226; publicerad online 28 oktober 2015 Efter publiceringen av denna artikel vill författarna lägga till en kompletterande fil. Denna

En vanlig mutation i COG7-genen med en konsekvent fenotyp inklusive mikrocefali, adducerade tummar, tillväxtfördröjning, VSD och avsnitt av hypertermi

En vanlig mutation i COG7-genen med en konsekvent fenotyp inklusive mikrocefali, adducerade tummar, tillväxtfördröjning, VSD och avsnitt av hypertermi

En rättelse till denna artikel publicerades den 21 juni 2007 Abstrakt Vi beskriver de kliniska och biokemiska kännetecknen hos tre patienter från två olika familjer som har diagnostiserats med medfødt störning av glykosylering typ IIe på grund av en defekt i Conserved Oligomeric Golgi complex (COG) 7; en av de åtta underenheterna för COG. Syskon

Genomfattande poolningssätt identifierar SPATA5 som ett nytt känslighetsområde för alopecia areata

Genomfattande poolningssätt identifierar SPATA5 som ett nytt känslighetsområde för alopecia areata

Abstrakt Alopecia areata (AA) är en vanlig håravfallsstörning, som tros vara en vävnadsspecifik autoimmun sjukdom. Tidigare forskning har identifierat några AA-känslighetsgener, varav de flesta är inblandade i autoimmunitet. För att identifiera nya genetiska varianter och ytterligare klargöra den genetiska grunden för AA, utförde vi en genomomfattande associeringsstudie med strategin för poolad DNA-genotypning (729 fall, 656 kontroller). Den starka

19q13.11 kryptisk radering: beskrivning av två nya fall och indikation för en roll av WTIP-haploinsufficiens i hypospadi

19q13.11 kryptisk radering: beskrivning av två nya fall och indikation för en roll av WTIP-haploinsufficiens i hypospadi

ämnen Kromosomavvikelse Urogenitala sjukdomar Abstrakt Utvecklingsförseningar / intellektuella funktionsnedsättningar, talstörningar, före- och postnatalt tillväxtfördröjning, mikrocefali, tecken på ektodermal dysplasi och könsdelade missbildningar hos män (hypospadi) representerar den fenotypiska kärnan i det nyligen framväxande syndromet 19q13.11. Med anvä

Wolf-Hirschhorn syndrom ansiktsdysmorfa funktioner hos en patient med en terminal 4p16.3 radering telomerisk till WHSCR och WHSCR 2 regioner

Wolf-Hirschhorn syndrom ansiktsdysmorfa funktioner hos en patient med en terminal 4p16.3 radering telomerisk till WHSCR och WHSCR 2 regioner

Abstrakt Vi rapporterar om en patient med utvecklingsfördröjning och flera ansiktsegenskaper som påminner om Wolf – Hirschhorn syndrom, som bär en terminal 4p16.3-radering av minst 1, 691 Mb och maximalt 1, 698 Mb. Denna borttagning innehåller FGFRL1- genen men inkluderar inte WHSC1- genen. Med tanke på dess uttrycksmönster och dess engagemang i bildning av ben och brosk under embryonisk utveckling representerar FGFRL1- genen en sannolik kandidatgen för en del av ansiktsegenskaperna hos Wolf-Hirshhorn-syndrom hos patienter med radering av 4p16.3. Introd

Funktionella konsekvenser av mitokondriell tRNATrp- och tRNAArg-mutationer som orsakar kombinerade OXPHOS-defekter

Funktionella konsekvenser av mitokondriell tRNATrp- och tRNAArg-mutationer som orsakar kombinerade OXPHOS-defekter

Abstrakt Kombinerad oxidativ fosforylering (OXPHOS) -systembrister är en grupp av mitokondriella störningar som är förknippade med en rad kliniska fenotyper och genetiska defekter. De förekommer i cirka 30% av alla OXPHOS-störningar och cirka 4% är kombinerade komplexa I-, III- och IV-brister. I den

Innebär borttagning av groddar av PIP-genen en stor risk för cancer?

Innebär borttagning av groddar av PIP-genen en stor risk för cancer?

ämnen Cancergenomik Vi vill uppmärksamma cancergenetiker på en speciell genetisk variant av Prolactin-Induced Protein ( PIP) -genen som kan vara en viktig predisponerande faktor för cancer på grund av dess höga frekvens och signifikanta samband med cancer, som bestämts i denna studie. I en initial skärm för kopia-nummervariation (CNV) för borttagning av groddar i 123 brasilianska cancerpatienter som valts ut som hög risk antingen på grund av tidig ålder av början (pediatrisk cancer) eller en positiv familjehistoria ( TP53- negativ Li – Fraumeni och APC / MUTYH- negativa familjeadenomatösa polyp

Angiogenetiska axlar angiopoietins / Tie2 och VEGF vid familjär bröstcancer

Angiogenetiska axlar angiopoietins / Tie2 och VEGF vid familjär bröstcancer

ämnen Bröstcancer Cancergenetik Riktade terapier Tumörangiogenes Abstrakt Angiogenes leder till att blodkärl bildas från tidigare existerande, vilket tillåter tumörtillväxt. Vaskulär endotelial tillväxtfaktor (VEGF) och Angiopoietins (Ang-1, Ang-2) har en central roll i tumörangiogenes men få data om deras roll i ärftlig bröstcancer finns tillgängliga. Syftet med de

Omfattande oligonukleotid-array-jämförande genomisk hybridiseringsanalys: ny insikt om molekylär patologi för DMD-genen

Omfattande oligonukleotid-array-jämförande genomisk hybridiseringsanalys: ny insikt om molekylär patologi för DMD-genen

ämnen Jämförande genomisk hybridisering Mutation Neuromuskulär sjukdom Abstrakt Vi rapporterar om effektiviteten hos en anpassad designad oligonukleotidbaserad jämförande genomisk hybridiseringsmikroarray (array-CGH) för att förhöra kopieringsnummer över hela den 2, 2-Mb genomiska regionen av DMD- genen och dess användbarhet vid diagnos. Den högup

Nästa generations sekvensering i en familj med autosomalt recessivt Kahrizi-syndrom (OMIM 612713) avslöjar en homozygot ramskiftmutation i SRD5A3

Nästa generations sekvensering i en familj med autosomalt recessivt Kahrizi-syndrom (OMIM 612713) avslöjar en homozygot ramskiftmutation i SRD5A3

ämnen Sjukdomgenetik Mutation Nästa generations sekvensering Abstrakt Som en del av en storskalig, systematisk insats för att upptäcka de molekylära orsakerna till autosomal recessiv mental retardering har vi tidigare beskrivit ett nytt syndrom bestående av mental retardering, coloboma, grå starr och kyfos (Kahrizi syndrom, OMIM 612713) och kartlade den underliggande genen till ett 10, 4-Mb-intervall nära centromeren på kromosom 4. Genom a

De novo-mikroduplikationer vid 1q41, 2q37.3 och 8q24.3 hos patienter med VATER / VACTERL-förening

De novo-mikroduplikationer vid 1q41, 2q37.3 och 8q24.3 hos patienter med VATER / VACTERL-förening

ämnen Sjukdomgenetik Genduplicering Abstrakt Förkortningen VATER / VACTERL-föreningen beskriver kombinationen av minst tre av följande medfödda anomalier: ryggradsdefekter (V), anorektal missbildningar (A), hjärtdefekter (C), tracheoesophageal fistel med eller utan matstrups atresi (TE), njurmissbildningar) (R) och leddefekter (L). Vi s

ABCA1-genotyp av moder är förknippat med svårighetsgraden av Smith – Lemli – Opitz-syndrom och med livskraften hos patienter som är homozygota för nollmutationer.

ABCA1-genotyp av moder är förknippat med svårighetsgraden av Smith – Lemli – Opitz-syndrom och med livskraften hos patienter som är homozygota för nollmutationer.

ämnen Genetisk föreningsstudie Metaboliska störningar Mutation Abstrakt Smith – Lemli – Opitz-syndromet (SLOS [MIM ​​270400]) är ett autosomalt recessivt malformationssyndrom som visar en stor variation med avseende på svårighetsgrad. SLOS orsakas av mutationer i ster7sterol-reduktasgenen ( DHCR7 ), som stör biosyntesen i kolesterol. Fenotypisk va

Allt jag ville veta om medfödda utvecklingsfel

Allt jag ville veta om medfödda utvecklingsfel

Av RE Stevenson & JG Hall , Human Malformations and Related Anomalies, Second Edition, Oxford University Press, Oxford, UK, 2005. ISBN-10: 0195165683; ISBN-13: 978-0195165685 Titeln på denna opus väcker höga förväntningar: en bok där inte bara medicinska genetiker, kliniker, men också biologer hittar vad de vill veta om medfödda missbildningar och andra utvecklingsfel hos människor. Efter 1

Vad du alltid ville veta om Huntingtons sjukdom

Vad du alltid ville veta om Huntingtons sjukdom

Huntingtons sjukdom (andra upplagan) Av Oliver Quarrell , thefacts-serien, Oxford University Press, 2008 ISBN 978-0-19-921201-9 (Pbk) Denna bok är en uppdatering av den första upplagan som publicerades 1999 och resultat från författarens långa erfarenhet av Huntingtons sjukdom (HD) i ett kliniskt genetiskt sammanhang samt från hans nära samarbete med HD-föreningen. De fle

Stargardt sjukdom: mot att utveckla en modell för att förutsäga fenotyp

Stargardt sjukdom: mot att utveckla en modell för att förutsäga fenotyp

ämnen Sjukdomgenetik Makuladegeneration Den ursprungliga artikeln publicerades den 22 maj 2013 Rättelse till : European Journal of Human Genetics (2013) 21, 1173–1176; doi: 10, 1038 / ejhg.2013.92; publicerad online 22 maj 2013 Sedan online-publicering har författarna upptäckt att Arg602Trp-mutationen i själva verket är c.1804C&g

Tektoniska genmutationer hos patienter med Joubert-syndrom

Tektoniska genmutationer hos patienter med Joubert-syndrom

ämnen Sjukdomgenetik Mutation Neurologiska störningar Abstrakt Hittills har mycket få patienter med sekvensvarianter i de nära besläktade tektoniska generna TCTN1-3 beskrivits. Genom nästa generations sekvensering (NGS) av flergenpaneler hos patienter med Joubert-syndrom identifierade vi ytterligare två patienter och sammanfattar vad som för närvarande är känt om fenotyperna förknippade med sekvensvarianter i dessa gener. Hos en poj

Genomfattande associeringssökning av neuropatiska smärtsymtom efter total ledutbyte belyser en variant av proteinkinas C-genen

Genomfattande associeringssökning av neuropatiska smärtsymtom efter total ledutbyte belyser en variant av proteinkinas C-genen

ämnen Genetisk predisposition för sjukdom artros Abstrakt Neuropatiska smärtliknande ledsymptom (NP) ses hos en del av individer som diagnostiserats med artros (OA) och efter total ledutbyte (TJR). I denna studie utförde vi en genombreddsassocieringsstudie (GWAS) med användning av NP enligt definitionen av painDETECT-frågeformuläret (poäng> 12 som indikerar möjlig NP) i 613 deltagare efter TJR rekryterade från Nottinghamshire (UK). Förekoms

Rollen för sarcomere-genmutationer hos patienter med idiopatisk utvidgad kardiomyopati

Rollen för sarcomere-genmutationer hos patienter med idiopatisk utvidgad kardiomyopati

Abstrakt Vi undersökte en dansk kohort av 31 icke-relaterade patienter med idiopatisk utvidgad kardiomyopati (IDC), för att bedöma den roll som mutationer i sarkomära proteingener spelar i IDC. Patienterna screenades genetiskt genom kapillärelektrofores-enkelsträngskonformationspolymorfism och därefter genom dubbelriktad DNA-sekvensering av konformer i de kodande regionerna för MYH7 , MYBPC3 , TPM1, ACTC, MYL2, MYL3, TNNT2, CSRP3 och TNNI3. Åtta p

Motiveringar, oro och preferenser för deltagare i personligt genomföljande forskning: Baslinjefynd från HealthSeq-projektet

Motiveringar, oro och preferenser för deltagare i personligt genomföljande forskning: Baslinjefynd från HealthSeq-projektet

ämnen Mänskligt beteende Personlig medicin Den ursprungliga artikeln publicerades den 3 juni 2015 Korrigering av : European Journal of Human Genetics publicering online, 3 juni 2015; doi: 10, 1038 / ejhg.2015.118 Efter publiceringen insåg författarna att de hade utelämnat kompletterande tabeller 4 och 5. Des

Anrikning av HapMap-rekombinations hotspot-förutsägelser kring mänskliga nervsystemets gener: bevis för positivt urval?

Anrikning av HapMap-rekombinations hotspot-förutsägelser kring mänskliga nervsystemets gener: bevis för positivt urval?

Abstrakt Kanaler och utvecklingsgener tillhör de molekylära nyckelaktörerna i det mänskliga centrala nervsystemet (CNS). Mutationer i dessa gener orsakar ofta monogen neurologisk sjukdom och jämförelser mellan varandra visade minskad divergens. Å andra sidan hade accelererad utveckling av gener med roller i neurotransmission och utveckling visat ett utbrett positivt urval hos hominider. I den

Klinisk nyttokort för: Fenylketonuria

Klinisk nyttokort för: Fenylketonuria

1. SYKDOMSEGENSKAPER 1.1 Sjukdomens namn (synonymer) Fenylketonuri. Fenylalaninhydroxylasbrist som kräver behandling. 1.2 OMIM # av sjukdomen 261.600. 1.3 Namn på de analyserade generna eller DNA / kromosomsegmenten PAH. 1.4 OMIM # av genen / generna 612.349. 1.5 Mutationsspektrum Mer än 500 olika mutationer är kända, främst punktmutationer (missense, nonsense, splice), men också mindre borttagningar och duplikationer. Stora

Djup-intronisk ATM-mutation detekterad genom genomisk utvävning och korrigerats in vitro av antisense morfolino oligonukleotid (AMO)

Djup-intronisk ATM-mutation detekterad genom genomisk utvävning och korrigerats in vitro av antisense morfolino oligonukleotid (AMO)

ämnen Antisense oligonukleotidterapi Mutation Nästa generations sekvensering Abstrakt Den senaste utvecklingen av nästa generations DNA-sekvenseringstekniker (NGS) förändrar metoden för att söka efter mutationer i mänskliga genetiska sjukdomar. Vi använde NGS för att studera en AT-patient där en av de två förväntade mutationerna inte hittades efter DHPLC, cDNA-sekvensering och MLPA-screening. Det 160 kb s

Prospektiv diagnostisk analys av kopianalvarianter med användning av SNP-mikroarrayer hos individer med autismspektrumstörningar

Prospektiv diagnostisk analys av kopianalvarianter med användning av SNP-mikroarrayer hos individer med autismspektrumstörningar

ämnen Diagnos Microarray-analys Strukturell variation Abstrakt Varianter av kopieringsnummer (CNV) har upprepade gånger visat sig orsaka eller predisponera för autismspektrumstörningar (ASD). För diagnostiska ändamål screenade vi 194 individer med ASD: er för CNV: er med hjälp av Illumina SNP-matriser. I flera

Utvecklingen av den offentliga och yrkespolitiska kommittén

Utvecklingen av den offentliga och yrkespolitiska kommittén

ämnen Genetik institutioner Politik ESHG: s offentliga och yrkespolitiska kommitté (PPPC) inrättades 1998 och föregicks av föreningens etiska kommitté, inrättad 1994 och ordförande av Marcus Pembrey. Etikkommittén hade en smalare uppgift än PPPC och arbetade främst med att harmonisera riktlinjerna för mänskliga genetiker i Europa. Del 1: Ségo

Klinisk nyttekort för: poikiloderma med neutropeni

Klinisk nyttekort för: poikiloderma med neutropeni

ämnen Genetisk testning Hematologiska sjukdomar Mutation 1. SYKDOMSEGENSKAPER 1.1 Sjukdomens namn (synonymer) Poikiloderma med Neutropenia (PN, Clericuzio-typ Poikiloderma med Neutropenia). 1.2 OMIM # av sjukdomen # 604.173. 1.3 Namn på de analyserade generna eller DNA / kromosomsegmenten C16orf57 ( kromosom 16 öppen läsram 57 ). 1.

Klinisk nyttokort för: Long-QT-syndrom (typ 1–13)

Klinisk nyttokort för: Long-QT-syndrom (typ 1–13)

ämnen arytmier Genetisk testning 1. SYKDOMSEGENSKAPER 1.1 Sjukdomens namn (synonymer) Long-QT-syndrom (LQT, LQTS, Romano – Ward-syndrom, undergrupper: Jervell och Lange – Nielsen-syndrom, Andersen-syndrom, Timothy-syndrom). 1.2 OMIM # av sjukdomen 192500 (LQT1); 613688 (LQT2); 603830 (LQT3); 600919 (LQT4); 613695 (LQT5); 613693 (LQT6); 170390 (LQT7), Andersen syndrom; 601005 (LQT8), Timothy syndrom; 611818 (LQT9); 611819 (LQT10); 611820 (LQT11); 612955 (LQT12); 613485 (LQT13); 220400 Jervell och Lange – Nielsen syndrom 1, JLNS1; 612347 Jervell och Lange – Nielsen syndrom 2, JLNS2 1.3 Namn p

Effekten av presymptomatisk genetisk testning på unga vuxna: en systematisk översyn

Effekten av presymptomatisk genetisk testning på unga vuxna: en systematisk översyn

ämnen Genetisk rådgivning Abstrakt Presymptomatisk och prediktiv genetisk testning bör innebära ett övervägt val, vilket är särskilt sant när testning genomförs i tidig vuxen ålder. Unga vuxna befinner sig i ett viktigt livsfas eftersom de kan utveckla en karriär, bilda partnerskap och potentiellt bli föräldrar: presymptomatiska tester kan påverka många aspekter av deras framtida liv. Syftet med den

Genbaserad interaktionsanalys genom att inkorporera extern information om lika obalans

Genbaserad interaktionsanalys genom att inkorporera extern information om lika obalans

ämnen Genetisk interaktion Genetisk kopplingsstudie programvara Abstrakt Gengeninteraktioner spelar en viktig roll i komplexa mänskliga sjukdomar. Detektion av gen-gen-interaktioner har länge varit en utmaning på grund av deras komplexitet. Standardmetoden som syftar till att upptäcka SNP – SNP-interaktioner kan vara otillräcklig eftersom den inte modellerar kopplingsdifferens (LD) mellan SNP: er i varje gen och kan förlora kraften på grund av ett stort antal jämförelser. För att fö

Tandanomalier och genetik, inklusive genetiska syndrom

Tandanomalier och genetik, inklusive genetiska syndrom

ämnen Tandsjukdomar Sjukdomgenetik Dento / oro / craniofacial anomalier och genetik Redigerad av Bloch-Zupan A, Sedano HO & Scully C Publicerad av: Elsevier ISBN-10: 0124160387; ISBN-13: 978-0124160385, 45, 99 £ / 74, 95 $ Denna bok av professor Bloch-Zupan och medarbetare, professorer Sedano och Scully, är tydlig och lättläst. Mål

Autosomal dominerande sen-startande spinalmotorisk neuronopati är kopplad till ett nytt lokus på kromosom 22q11.2-q13.2

Autosomal dominerande sen-startande spinalmotorisk neuronopati är kopplad till ett nytt lokus på kromosom 22q11.2-q13.2

ämnen Neuromuskulär sjukdom Befolkningsgenetik Abstrakt Spinal muskulära atrofier (SMA) är ärftliga störningar som kännetecknas av degeneration av lägre motoriska neuroner. Olika SMA-typer är kliniskt och genetiskt heterogena och många av dem visar betydande fenotypisk överlappning. Vi beskrev nyligen den kliniska fenotypen av en ny sjukdom i två finländska familjer med en unik autosomal dominerande senare motorisk neuronopati. De studerad

Klinisk nyttokort för: Fosfomannomutas 2-brist

Klinisk nyttokort för: Fosfomannomutas 2-brist

ämnen Sjukdomgenetik Metaboliska störningar 1. Sjukdomskarakteristika 1.1 Sjukdomens namn (synonymer) Fosfomannomutas 2-brist, PMM2-CDG, CDG-Ia, Jaeken sjukdom. 1.2 OMIM # av sjukdomen 212.065. 1.3 Namn på de analyserade generna eller DNA / kromosomsegmenten PMM2. 1.4 OMIM # av genen / generna 601.78

Preimplantation genetisk diagnos (PGD) för Huntingtons sjukdom: erfarenheten av tre europeiska centra

Preimplantation genetisk diagnos (PGD) för Huntingtons sjukdom: erfarenheten av tre europeiska centra

En rättelse till denna artikel publicerades den 16 augusti 2012 Abstrakt Denna studie ger en översikt av 13 års erfarenhet av preimplantation genetisk diagnos (PGD) för Huntingtons sjukdom (HD) vid tre europeiska PGD-centra i Bryssel, Maastricht och Strasbourg. Information om alla 331 PGD-intag för HD, paras reproduktionshistoria, PGD-strategi, behandlingscykler och resultat mellan 1995 och 2008 samlades fram prospektivt. Av

Användning av stereotypa mutationsmotiv för att definiera upplösningsgränser för den ultra-djupa resekventeringen av mitokondriellt DNA

Användning av stereotypa mutationsmotiv för att definiera upplösningsgränser för den ultra-djupa resekventeringen av mitokondriellt DNA

ämnen Databehandling Diagnostiska markörer Screening med hög kapacitet Neuromuskulär sjukdom Abstrakt Massivt parallell resekvensering av mitokondriellt DNA (mtDNA) har lett till betydande framsteg i studien av heteroplasmatiska mtDNA-varianter inom hälsa och sjukdom, men säker upplösning av mycket låga nivåvarianter (C, från patient med MNGIE, mitokondrial neurogastrointestinal encefalomopati) och jämför jämförande mutation mönsterdistribution med friskt mtDNA genom ligeringsmedierad djup resekvensering (Applied Biosystems SOLiD). Vi har empiri

Identifiering av en ny nonsensmutation i GFAP: s stångdomän som är associerad med Alexander-sjukdomen

Identifiering av en ny nonsensmutation i GFAP: s stångdomän som är associerad med Alexander-sjukdomen

ämnen Sjukdomgenetik Mutation Neurodegenerativa sjukdomar Abstrakt Alexander-sjukdomen (AxD) är en astrogliopati som främst påverkar det vita ämnet i centrala nervsystemet (CNS). AxD orsakas av mutationer i en gen som kodar GFAP (glial fibrillary acidic protein). GFAP- mutationerna i AxD har rapporterats fungera på ett sätt som får funktionen, delvis på grund av att de identifierade mutationerna genererar praktiskt taget fullföljande GFAP. Vi hitta

Consanguinity in Centre d'Étude du Polymorphisme Humain (CEPH) stamtavlor

Consanguinity in Centre d'Étude du Polymorphisme Humain (CEPH) stamtavlor

ämnen Genetiska tekniker Genetisk variation Abstrakt En uppsättning av Centre d'Etude du Polymorphisme Humain (CEPH) cellinjer fungerar som en stor referenssamling som har använts allmänt som ett riktmärke för allelfrekvenser i analysen av genetiska varianter, för att skapa kopplingskartor av det mänskliga genomet, för att studera genetik för genuttryck, för att tillhandahålla prover till HapMap- och 1000 Genomes-projekten och för en mängd andra tillämpningar. Ett tydligt i

En kvalitativ utforskning av mödrarnas och fädernas upplevelser av att få ett barn med Klinefelter syndrom och processen att nå denna diagnos

En kvalitativ utforskning av mödrarnas och fädernas upplevelser av att få ett barn med Klinefelter syndrom och processen att nå denna diagnos

ämnen Diagnos hypogonadism Medicinsk genetik Abstrakt Klinefelter syndrom (KS) är ett vanligt genetiskt tillstånd som för närvarande är underdiagnostiserat. Fenotypen är bred med fysiska, medicinska och psykosociala funktioner som sträcker sig från mild till svår. När ett barn diagnostiseras med KS kan föräldrarna spendera månader till år på att söka efter en diagnos. Denna studie an

EMQN riktlinjer för bästa praxis för molekylär genetisk diagnos av ärftlig hemokromatos (HH)

EMQN riktlinjer för bästa praxis för molekylär genetisk diagnos av ärftlig hemokromatos (HH)

ämnen sjukdomar Abstrakt Molekylär genetisk testning för ärftlig hemokromatos (HH) erkänns som ett referensprov för att bekräfta diagnosen av misstänkt HH eller för att förutsäga dess risk. De allra flesta (vanligtvis> 90%) av patienter med kliniskt karaktäriserad HH är homozygota för p.C282Y-variant

MCT8-mutationsanalys och identifiering av den första kvinnan med Allan – Herndon – Dudley-syndrom på grund av förlust av MCT8-uttryck

MCT8-mutationsanalys och identifiering av den första kvinnan med Allan – Herndon – Dudley-syndrom på grund av förlust av MCT8-uttryck

Abstrakt Mutationer i sköldkörtelmonokarboxylattransportör 8-genen ( MCT8 / SLC16A2 ) har rapporterats resultera i X-kopplad mental retardering (XLMR) hos patienter med kliniska egenskaper hos Allan – Herndon – Dudley-syndrom (AHDS). Vi utförde MCT8- mutationsanalys inklusive 13 XLMR-familjer med LOD-poäng> 2, 0, 401 manliga MR-sysselsättningar och 47 sporadiska manliga patienter med AHDS-liknande kliniska funktioner. En nonse

Människor på de brittiska öarna: preliminär analys av genotyper och efternamn i en population i Storbritannien

Människor på de brittiska öarna: preliminär analys av genotyper och efternamn i en population i Storbritannien

Abstrakt Det finns ett stort intresse för en finskalig befolkningsstruktur i Storbritannien, både som en signatur av historiska invandringshändelser och på grund av den inverkan befolkningsstrukturen kan ha på studier av sjukdomsföreningar. Även om befolkningsstrukturen verkar ha en mindre inverkan på den nuvarande generationen genomgenomfattande föreningsstudier, kommer det troligtvis att ha en betydande del i nästa generation av studier som är utformade för att söka efter sällsynta varianter. Ett kraftful

Klinisk nyttokort för: 15q13.3 mikrodeletionssyndrom

Klinisk nyttokort för: 15q13.3 mikrodeletionssyndrom

ämnen Klinisk genetik 1. Sjukdomskarakteristika 1.1 Sjukdomens namn (synonymer) 15q13.3 mikrodeletionssyndrom / Del (15) (q13.3) /15q13.3 monosomisyndrom. 1.2 OMIM # av sjukdomen 612001. 1.3 Namn på de analyserade generna eller DNA / kromosomsegmenten 15q13.2q13.3, RefSeq NC_000015.9 (hg19 human referenssekvens, februari 2009, build 37).

Avvikelser i rapporteringen av CAG-upprepade längder för Huntingtons sjukdom

Avvikelser i rapporteringen av CAG-upprepade längder för Huntingtons sjukdom

Abstrakt Huntingtons sjukdom är resultatet av en upprepad CAG-utvidgning inom Huntingtin- genen; detta mäts rutinmässigt i diagnostiska laboratorier. Europeiska Huntington's Disease Network REGISTRY-projektet mäter centralt CAG-upprepade längder på färska prover; dessa jämfördes med de ursprungliga resultaten från 121 laboratorier i 15 länder. Vi rappor

Gemensam föreningsanalys av en binär och en kvantitativ egenskap i familjeprover

Gemensam föreningsanalys av en binär och en kvantitativ egenskap i familjeprover

ämnen Beräkningsbiologi och bioinformatik Genomfattande föreningsstudier Abstrakt Under senare år har förbättrad teknik för genotypning och sekvensering möjliggjort upptäckten av nya lokaler förknippade med olika sjukdomar eller egenskaper. Genom att testa föreningen med varje enkel-nukleotidvariant (SNV) separat har till exempel genomfattande föreningsstudier (GWAS) uppnått en enorm framgång när det gäller att identifiera SNV: er associerade med specifika egenskaper. Lite är dock k

Detektion av känslighetsgener som modifierare på grund av skillnader i undergruppen i komplex sjukdom

Detektion av känslighetsgener som modifierare på grund av skillnader i undergruppen i komplex sjukdom

ämnen Sjukdomgenetik Genetisk predisposition för sjukdom Abstrakt Komplexa sjukdomar involverar alltid flera gener och uppvisar ofta variabla symptomprofiler. I vilken utsträckning sjukdomssymptom, förlopp och svårighetsgrad skiljer sig mellan drabbade individer kan bero på underliggande genetisk heterogenitet. Gene

Med hjälp av exome-sekvensering för att identifiera varianter som ärvts från mosaikföräldrar

Med hjälp av exome-sekvensering för att identifiera varianter som ärvts från mosaikföräldrar

ämnen Genetisk testning Medicinsk genomik Nästa generations sekvensering Abstrakt Hela exome sequencing (WES) har möjliggjort upptäckten av gener och varianter som orsakar sällsynt människosjukdom. Detta uppnås ofta genom att jämföra nonsynonyma varianter mellan icke-relaterade patienter, och särskilt för sporadisk eller recessiv sjukdom, identifierar ofta en enda eller få kandidatgener för vidare övervägande. Trots potenti

Alagille syndrom: patogenes, diagnos och hantering

Alagille syndrom: patogenes, diagnos och hantering

Abstrakt Alagille syndrom (ALGS), även känt som arteriohepatisk dysplasi, är en multisystemstörning på grund av defekter i komponenterna i Notch-signalvägen, oftast på grund av mutation i JAG1 (ALGS typ 1), men i en liten del av fallen mutation i NOTCH2 (ALGS typ 2). De huvudsakliga kliniska och patologiska kännetecknen är kronisk kolestas på grund av brist på intrahepatiska gallgångar, perifera lungartärstenos, mindre anstalier i ryggradssegmentering, karakteristiska ansiktsbehandlingar, posteriora embryotoxon / främre segmentavvikelser, pigmentär retinopati och dysplastiska njurar. Det följer

Serum eller plasmabrosk oligomer matrisproteinkoncentration som diagnostisk markör vid pseudoachondroplasi: differentiell diagnos av en familj

Serum eller plasmabrosk oligomer matrisproteinkoncentration som diagnostisk markör vid pseudoachondroplasi: differentiell diagnos av en familj

Abstrakt Pseudoachondroplasia (PSACH) är en autosomal-dominerande osteokondrodysplasi på grund av mutationer i genen som kodar broskoligomeriskt matrisprotein (COMP). Klinisk diagnos av PSACH baseras främst på familjehistoria, fysisk undersökning och radiografisk utvärdering och är ibland extremt svår, särskilt hos vuxna patienter. Genetis

Medfödda sjukdomar i glykosylering: andra orsaker till iktyos

Medfödda sjukdomar i glykosylering: andra orsaker till iktyos

ämnen Sjukdomgenetik sjukdomar glykosylering Vi läser med intresse den omfattande granskningen av Schmuth et al 1 om ärvda iktoser / generaliserade Mendeliska störningar av kornifiering. Vi vill påpeka att vissa medfödda sjukdomar i glykosylering (CDG) utgör iktyos. Föreningar har beskrivits för MPDU1-CDG (tidigare CDG-If), DOLK-CDG (CDG-Im), SRD5A3-CDG (CDG-Iq) och PIGL-CDG (CHIME-syndrom, Zunich neuroectodermal syndrom). MPDU1-C

Prenatal SNP-arraytest hos 1000 foster med ultraljudsanomalier: orsakande, oväntade och mottagliga CNV: er

Prenatal SNP-arraytest hos 1000 foster med ultraljudsanomalier: orsakande, oväntade och mottagliga CNV: er

ämnen mosaicism Abstrakt För att utvärdera det diagnostiska värdet av enkel-nukleotidpolymorfism (SNP) -uppsättningstest i 1033 foster med ultraljudsanomalier undersökte vi förekomsten och genetiska beskaffenheten av patogena fynd. Vi omklassificerade alla patogena fynd i tre kategorier: orsakande fynd; oväntade diagnoser (UD); och känslighetslokaler (SL) för neuro-utvecklingsstörningar. Efter ute

Befolkningsbaserad screening för föreställningsbärare: hur potentiella användare från den allmänna befolkningen ser ett test för 50 allvarliga sjukdomar

Befolkningsbaserad screening för föreställningsbärare: hur potentiella användare från den allmänna befolkningen ser ett test för 50 allvarliga sjukdomar

ämnen Genetisk testning Abstrakt Med det ökade internationella fokuset på personlig hälsovård och förebyggande medicin har nästa generations sequencing (NGS) avsevärt utvidgat alternativen för screening av allvarliga, recessivt ärvda sjukdomar. NGS-screeningtest erbjuder inte bara reproduktionsalternativ som inte tidigare varit tillgängliga för par, utan de kan också i slutändan minska antalet barn födda med förödande störningar. Hittills har för

En ovanlig klinisk svårighetsgrad av 16p11.2-deletionssyndrom orsakat av omaskerad recessiv mutation av CLN3

En ovanlig klinisk svårighetsgrad av 16p11.2-deletionssyndrom orsakat av omaskerad recessiv mutation av CLN3

ämnen Jämförande genomisk hybridisering Sjukdomgenetik Mutation Neurodegenerativa sjukdomar Abstrakt Med introduktionen av matriskomparativ genomisk hybridisering (aCGH) -tekniker i den diagnostiska inställningen för patienter med utvecklingsfördröjning och medfödda missbildningar har många nya mikrodeletionssyndrom erkänts. Ett av d

Variabel uppsättning anrikningsanalys i genomomfattande föreningsstudier

Variabel uppsättning anrikningsanalys i genomomfattande föreningsstudier

ämnen Genetisk variation Genomfattande föreningsstudier Statistiska metoder Abstrakt Komplexa sjukdomar som hypertoni är i sig mångfaktoriella och involverar många faktorer av mild till minut effektstorlek. En genombreddsassocieringsstudie (GWAS) testar vanligtvis hundratusentals polymorfismer med en nukleotid (SNP) och erbjuder möjlighet att utvärdera aggregerade effekter av många genetiska varianter med effekter som är för små för att detektera individuellt. Genuppsätt

Polymorfismer i hjärtnatriumkanalpromotorn som visar variant in vitro-uttrycksaktivitet

Polymorfismer i hjärtnatriumkanalpromotorn som visar variant in vitro-uttrycksaktivitet

Abstrakt Variabel transkription av hjärtnatriumkanalgenen är en kandidatmekanism som bestämmer arytmiskänslighet. Vi har tidigare klonat och karakteriserat kärnpromotorn och flankeringsområdet för SCN5A , kodande hjärtnatriumkanalen . Mutationsförlustmutationer i denna gen har rapporterats hos ∼ 20% av patienterna med Brugada syndrom, en ärftlig elektrisk hjärtsjukdom som är förknippad med en hög förekomst av livshotande arytmier. I denna studie

Kopiera antalet variationer hos 375 patienter med matstrupsbesvär och / eller tracheoesofageal fistel

Kopiera antalet variationer hos 375 patienter med matstrupsbesvär och / eller tracheoesofageal fistel

ämnen Klinisk genetik Matstrupe Abstrakt Oesophageal atresia (OA) med eller utan tracheoesophageal fistel (TOF) är sällsynta anatomiska medfödda missbildningar vars orsak är okänd hos över 90% av patienterna. En genetisk bakgrund föreslås, och bland de rapporterade genetiska defekterna finns variationer i kopianummer (CNV). Vi anto

Helgenom sekvensering i screening för nyfödda? Ett uttalande om den fortsatta vikten av riktade strategier i screeningprogram för nyfödda

Helgenom sekvensering i screening för nyfödda? Ett uttalande om den fortsatta vikten av riktade strategier i screeningprogram för nyfödda

ämnen Etik Abstrakt Tillkomsten och förfining av sekvenseringstekniker har resulterat i en minskning av både kostnaden och tiden som krävs för att generera data om hela sekvensen av det mänskliga genomet. Detta har ökat tillgängligheten för att använda helgenom-sekvensering och hel-exome sekvenseringsmetoder för analys i både forskning och kliniska sammanhang. Förväntnin

Lektioner från ett par syskon med BPAN

Lektioner från ett par syskon med BPAN

ämnen Sjukdomgenetik Genetisk variation Neurodegenerativa sjukdomar Den ursprungliga artikeln publicerades den 18 november 2015 Korrigering av: European Journal of Human Genetics publicerar den 18 november 2015; doi: 10, 1038 / ejhg.2015.242 Sedan publiceringen av ovanstående artikel har författarna insett att de hade utelämnat en viktig referens som publicerades online i denna tidskrift medan deras eget papper genomgick granskningsprocessen. I

Ett omnibustest för familjebaserade föreningsstudier med flera SNP och flera fenotyper

Ett omnibustest för familjebaserade föreningsstudier med flera SNP och flera fenotyper

ämnen Astma Genomfattande föreningsstudier Befolkningsgenetik Abstrakt Vi föreslår ett omnibus-familjebaserat associeringstest (MFBAT) som kan tillämpas på flera markörer och flera fenotyper och som bara har en frihetsgrad. Den föreslagna teststatistiken utvidgar nuvarande FBAT-metodik för att införliva flera markörer såväl som flera fenotyper. Med simuler

Haplotype-mönster i cancerrelaterade gener med ojämvikt med lång räckvidd i kopplingen: inga bevis på samband med bröstcancer eller positivt urval

Haplotype-mönster i cancerrelaterade gener med ojämvikt med lång räckvidd i kopplingen: inga bevis på samband med bröstcancer eller positivt urval

Abstrakt Den genomsnittliga längden på kopplingsdifferens (LD) -block i europeiska befolkningar är cirka 22 kb. I denna studie har vi valt 20 gener med LD-block större än 60 kb (med en medianlängd på 88 kb) från totalt 121 cancerrelaterade gener. Vi observerade begränsad haplotypdiversitet, med i genomsnitt tre haplotyper per gen som stod för mer än 90% av mångfalden, varav två är ett Yin-Yang-par i 95% av LD-blocken. Medelfrekven

Hela exome sekvensering identifierar nya varianter i PNPT1 orsakar oxidativa fosforyleringsdefekter och allvarliga multisystemsjukdomar

Hela exome sekvensering identifierar nya varianter i PNPT1 orsakar oxidativa fosforyleringsdefekter och allvarliga multisystemsjukdomar

ämnen Genomics Pediatriska neurologiska störningar Abstrakt De senaste framstegen i nästa generations sekvenseringsstrategier har lett till upptäckten av många nya sjukdomsgener. Vi beskriver här en icke-äkta familj med två drabbade pojkar som tidigt börjar med allvarlig axonal neuropati, optisk atrofi, intellektuell funktionsnedsättning, hörselneuropati och kroniska andnings- och tarmstörningar. Hel exome-

Lossa hyperlipidemia typ III (dysbetalipoproteinemia) långsamt

Lossa hyperlipidemia typ III (dysbetalipoproteinemia) långsamt

Uttrycket av hyperlipidemi av typ III (HLP) är ämnet i uppsatsen av Peter Henneman och hans kollegor. 1 Endast mycket få lipidstörningar verkar vara mer komplexa och dåligt förstått än typ III HLP av Fredrickson (eller så kallad dysbetalipoproteinemia). Detta gäller trots att typ III HLP hade beskrivits i detalj för mer än 33 år sedan 2 och sedan dess har studerats intensivt av de mest dedikerade, ledande lipidforskarna i hela världen. Typ III HLP

En MYLK-variant reglerar astmatisk inflammation via förändringar i sekundär mRNA-struktur

En MYLK-variant reglerar astmatisk inflammation via förändringar i sekundär mRNA-struktur

ämnen Astma Genetisk variation Abstrakt Myosin lättkedjekinas ( MYLK ) är en gen känd för att vara signifikant associerad med svår astma hos afroamerikaner. Här undersöker vi vidare molekylfunktionen hos en enkel-nukleotidpolymorfism (SNP), belägen i den icke-muskulära myosin-lätta kedja-kinasisoformen (nmMLCK), när det gäller astmakänslighet och patobiologi. Vi identifie

Genetiska markörpolymorfismer på kromosom 8q24 och prostatacancer i den nederländska befolkningen: DG8S737 kanske inte är den orsakande varianten

Genetiska markörpolymorfismer på kromosom 8q24 och prostatacancer i den nederländska befolkningen: DG8S737 kanske inte är den orsakande varianten

ämnen Cancergenetik Genetiska markörer Prostatacancer Abstrakt Prostatacancer är den vanligaste diagnosen cancer hos män i Europa och Nordamerika. Genomfattande föreningsstudier (GWAS) har upptäckt en förening med markörer på kromosom 8q24. Allel -8 av mikrosatellit DG8S737 med 22 upprepningar och allel A för enkel-nukleotidpolymorfismen (SNP) rs1447295 har visat sig vara signifikant associerad med prostatacancer. Eftersom

Användning av sekvensering av hel exome för att avbryta komplexa fenotyper

Användning av sekvensering av hel exome för att avbryta komplexa fenotyper

ämnen Genetikforskning Abstrakt Framgången med hel exome-sekvensering för att identifiera mutationer som orsakar enkelgen-störningar har dokumenterats väl. Däremot har hel exome-sekvensering hittills haft begränsad framgång i identifieringen av varianter som orsakar mer komplexa fenotyper som verkar osannolikt bero på störningen av en enda gen. Vi beskr

APC-genhypermetylering och prostatacancer: en systematisk granskning och metaanalys

APC-genhypermetylering och prostatacancer: en systematisk granskning och metaanalys

ämnen Cancergenetik Cancerscreening DNA-metylering Prostatacancer Abstrakt Prostatacancer (PCa) är en global sjukdom som drabbar ett stort antal män. Även om screening av prostataspecifikt antigen (PSA) används, är specificiteten begränsad. Denna studie analyserar känsligheten och specificiteten för adenomatous polyposis coli (APC) metylering för PCa-detektion i kroppsvätskor och vävnader. Genom att

Replikeringsanalys identifierar TYK2 som en multipel skleroskänslighetsfaktor

Replikeringsanalys identifierar TYK2 som en multipel skleroskänslighetsfaktor

Abstrakt I en ny genomömsövergripande studiestudie (GWAS) baserad på 12 374 icke-synonyma enstaka nukleotidpolymorfismer identifierade vi ett antal kandidatmångfaldiga skleroskänslighetsgener. Här beskriver vi den utökade analysen av 17 av dessa loci som genomfördes med ytterligare 4234 patienter, 2983 kontroller och 2053 triofamiljer. I den

Förfining av 12q14 mikrodeletionssyndrom: primordial dvärg och utvecklingsförsening med eller utan osteopoikilos

Förfining av 12q14 mikrodeletionssyndrom: primordial dvärg och utvecklingsförsening med eller utan osteopoikilos

Abstrakt I sina studier på molekylär basis av osteopoikilos har Menten et al identifierat tre individer med mikrodeletioner på kromosom 12q14.4, som avlägsnade flera gener inklusive LEMD3 , osteopoikilosgenen. Förutom osteopoikilos hade drabbade tillväxthämningar och utvecklingsförseningar. Vi rapporterar nu om en mindre 12q14.4 mikro

RMND1-brist förknippad med neonatal mjölksyraos, infantil början njursvikt, dövhet och multiorgan involvering

RMND1-brist förknippad med neonatal mjölksyraos, infantil början njursvikt, dövhet och multiorgan involvering

ämnen Metaboliska störningar Abstrakt RMND1 är ett integrerat mitokondrialt inre membranprotein som samlas i ett stort 240 kDa-komplex för att stödja translation av de 13 polypeptiderna som är kodade på mtDNA, vilka alla är väsentliga underenheter för de oxidativa fosforyleringskomplexen (OXPHOS). Variatio

Nya FGFR3-mutationer i exon 7 och implikationer för utvidgad screening av achondroplasi och hypokondroplasi: ett svar på Heuertz et al.

Nya FGFR3-mutationer i exon 7 och implikationer för utvidgad screening av achondroplasi och hypokondroplasi: ett svar på Heuertz et al.

Vi läste med stort intresse studien av Heuertz et al 1 i European Journal Human Genetics som presenterar nya FGFR3-mutationer som orsakar achondroplasi (ACH) och hypokondroplasi (HCH). Vi håller med författarnas rekommendation att utvidga screeningen för patienter med de kliniska egenskaperna hos ACH eller HCH som saknar de vanligaste varianterna av störningarna. Spe

Icke-invasiv prenatal test för aneuploidi och därefter: utmaningar med ansvarsfull innovation vid prenatal screening

Icke-invasiv prenatal test för aneuploidi och därefter: utmaningar med ansvarsfull innovation vid prenatal screening

ämnen Riskfaktorer En rättelse till denna artikel publicerades den 15 oktober 2015 Den här artikeln har uppdaterats Abstrakt Detta dokument innehåller ett gemensamt ESHG / ASHG-positionsdokument med rekommendationer om ansvarsfull innovation inom prenatal screening med icke-invasiv prenatal test (NIPT). Ta

Utvärdering av HapMap-data i sex populationer av europeisk härkomst

Utvärdering av HapMap-data i sex populationer av europeisk härkomst

Abstrakt Vi studerade hur väl de europeiska CEU-proverna som användes i Haplotype Mapping Project (HapMap) representerar fem europeiska populationer genom att analysera kärnfamiljprov från den svenska, finska, nederländska, brittiska och australiensiska (europeiska förfäder) befolkningen. Antalet prover från varje population (cirka 30 trio av föräldrar-avkommor) var lika stort som i HapMap-provuppsättningarna. En panel

En funktionell mutation i LDLR-promotorn (−139C> G) hos en patient med familjär hyperkolesterolemi

En funktionell mutation i LDLR-promotorn (−139C> G) hos en patient med familjär hyperkolesterolemi

Abstrakt En ny sekvensförändring i upprepning 3 av promotorn för lågdensitets lipoproteinreceptorn ( LDLR ) -gen, −139C> G, har identifierats hos en patient med familjär hyperkolesterolemi (FH). LDLR -139G har överförts till ett avkomma som också visar en FH-fenotyp. Övergående transfektionsstudier med användning av luciferasgenreporteranalyser avslöjade en avsevärd reduktion (74 ± 1, 4% SEM) i reportergenuttryck från −139G-varianssekvensen jämfört med vildtypssekvensen, vilket tyder starkt på att denna förändring är grunden för FH hos dessa patienter . Analys med användning av

Wilms tumör i Beckwith – Wiedemann syndrom och förlust av metylering på avtryckningscentrum 2: översyn av tumörövervakningsriktlinjer

Wilms tumör i Beckwith – Wiedemann syndrom och förlust av metylering på avtryckningscentrum 2: översyn av tumörövervakningsriktlinjer

ämnen Cancerepigenetik Riskfaktorer Abstrakt Beckwith – Wiedemann syndrom (BWS) är ett överväxt-syndrom orsakat av en mängd olika molekylära förändringar på kromosom 11p15.5. Barn med BWS har en betydande risk att utveckla Wilms-tumörer med risknivån beroende av den underliggande molekylära mekanismen. I synnerhet

Ökat uttryck av Hutchinson – Gilford progeriasyndrom trunkerat lamin A-transkript under åldrande av celler

Ökat uttryck av Hutchinson – Gilford progeriasyndrom trunkerat lamin A-transkript under åldrande av celler

Abstrakt De flesta fall av det segmentala progeroid syndromet, Hutchinson – Gilford progeria syndrom (HGPS), orsakas av en de novo dominerande mutation inom ett enda kodon av LMNA- genen. Denna mutation leder till ökad användning av ett internt skarvplats som genererar ett alternativt lamin A-transkript med en intern radering av 150 nukleotider, kallad lamin Aamin150. LM

Är genomomfattande föreningsstudier allt vi behöver för att dissekera den genetiska komponenten i komplexa mänskliga sjukdomar?

Är genomomfattande föreningsstudier allt vi behöver för att dissekera den genetiska komponenten i komplexa mänskliga sjukdomar?

Abstrakt Med tillgängligheten av täta kartor över anonyma och frekventa SNP som spänner över hela det mänskliga genomet, blir genomomfattande föreningsstudier nu verklighet. I detta dokument diskuterar vi användbarheten av dessa metoder för att upptäcka genetiska riskvarianter som är involverade i komplex sjukdomskänslighet och i bästa fall där en signal upptäcks, hur användbar det kommer att vara förståelsen av den patologiska processen. Huvudsaklig Med

En integrerad fenomisk metod för multivariat allelisk associering

En integrerad fenomisk metod för multivariat allelisk associering

Abstrakt Den ökade genomförbarheten av genombreddsassociation har resulterat i att associering har blivit den primära metoden som används för att lokalisera genetiska varianter som orsakar fenotypisk variation. Mycket uppmärksamhet har varit inriktad på de stora multipla testproblem som uppstår genom att analysera ett stort antal enstaka nukleotidpolymorfier. Uppblå

Potentiell förening av INSIG2 polymorfism rs7566605 och kroppsvikt i en kinesisk subpopulation

Potentiell förening av INSIG2 polymorfism rs7566605 och kroppsvikt i en kinesisk subpopulation

Abstrakt Herbert et al rapporterade associering med fetma hos en vanlig DNA-variant rs7566605 vid 10 kb uppströms om INSIG2- genen. Vi analyserade rs7566605 polymorfism på 3125 kinesiska i en tvärsnittsstudie. Vi hittade ingen signifikant förening av rs7566605 polymorfism med kroppsmassaindex (BMI) och midjeomkrets mellan alla deltagare ( P = 0, 52). Me

ABCA4-genanalys hos patienter med autosomal recessiv kon och dystrofier av konstavar

ABCA4-genanalys hos patienter med autosomal recessiv kon och dystrofier av konstavar

Abstrakt Transportörerna av ATP-bindande kassett (ABC) utgör en familj av stora membranproteiner, som transporterar olika substrat över membran. ABCA4-proteinet uttrycks i fotoreceptorer och fungerar eventuellt som en transportör för N- retinyliden-fosfatidyletanolamin ( N- retinyliden-PE), Schiff-basaddukt av all- trans- retinal med PE. Mut

Jämförelse av human kromosom 19q13 och syntenisk region på muskromosom 7 avslöjar från människa 11,6 Mb som innehåller fyra muskalciumavkännande receptorelaterade sekvenser: relevans för familjär godartad hypokalciurisk hyperkalcemi typ 3

Jämförelse av human kromosom 19q13 och syntenisk region på muskromosom 7 avslöjar från människa 11,6 Mb som innehåller fyra muskalciumavkännande receptorelaterade sekvenser: relevans för familjär godartad hypokalciurisk hyperkalcemi typ 3

Abstrakt Familjär godartad hypokalciurisk hyperkalkemi (FBHH) är en genetiskt heterogen störning som består av tre utsedda typer, FBHH1, FBHH2 och FBHH3, vars kromosomala placeringar är 3q21.1, 19p respektive 19q13. FBHH1 orsakas av mutationer av en kalciumavkänningsreceptor (CaSR), men avvikelserna bakom FBHH2 och FBHH3 är okända. FBHH3,

Den genomiska eran och medicinens nya gränser

Den genomiska eran och medicinens nya gränser

Redigerad av Dhavendra Kumar & Sir David Weatheral Genomics and Clinical Medicine ISBN: 978-0-19-518813-4 $ 175 Publicerad av: Oxford University Press: Oxford, UK: 2008 Under de senaste åren har framsteg inom många områden, inklusive biologi, biologisk teknik, informatik och fysik, lett från genetik till ett bredare fält, där helheten i en organisms gener kan betraktas som ett globalt system där olika komponenter interagerar med varandra och med externa faktorer. Det f

Praktiker och åsikter från neurologer angående användning av sekvensering av helgenom i kliniska miljöer: en webbaserad undersökning

Praktiker och åsikter från neurologer angående användning av sekvensering av helgenom i kliniska miljöer: en webbaserad undersökning

ämnen Genetikforskning Abstrakt Användningen av Whole-Genome Sequencing (WGS) i kliniska miljöer har tagit upp ett antal kontroversiella vetenskapliga och etiska frågor. Tillämpningen av WGS är särskilt relevant i neurologi, eftersom många tillstånd är svåra att diagnostisera. Vi genomförde en världsomfattande webbaserad undersökning för att utforska neurologernas åsikter om fördelarna med och oro för den kliniska användningen av WGS samt resurserna som krävs för att implementera det. Nästan hälften av 2

SNP-frekvensberäkning med massiv parallell sekvensering av poolat DNA

SNP-frekvensberäkning med massiv parallell sekvensering av poolat DNA

Abstrakt Förberedelse av genomiska regioner som har implicerats genom kopplings- och / eller associeringsstudier för att inrymma genetiska känslighetsplatser representerar ett nödvändigt steg för att identifiera kausala varianter. Massively parallel sequencing (MPS) erbjuder möjligheten till SNP-upptäckt och frekvensbestämning bland poolade DNA-prover. Strateg

Försiktighet vid generalisering av kända genetiska riskmarkörer för bröstcancer i alla etniska / raspopulationer

Försiktighet vid generalisering av kända genetiska riskmarkörer för bröstcancer i alla etniska / raspopulationer

ämnen Bröstcancer Epidemiologi Genetiska markörer Abstrakt Genomfattande föreningsstudier (GWAS) har identifierat vanliga varianter förknippade med bröstcancerrisk bland kvinnor i europeiska och asiatiska förfäder. För att bedöma generaliserbarheten mellan etniska / raspopulationer av en riskbedömning härrörande från genotypning av 12 starkt replikerade bröstcancer GWAS-träffar, utförde vi en fallkontrollstudie (2224 fall och 2827 kontroller) kapslade i Multiethnic Cohort (MEC) -studien initierade 1993–1996 och består av ämnen främst från europeisk-amerikansk, afroamerikansk, infödd hawaiiansk,

Ett nytt lokus för syndromisk kronisk idiopatisk tarmpseudoobstruktionskarta till kromosom 8q23 – q24

Ett nytt lokus för syndromisk kronisk idiopatisk tarmpseudoobstruktionskarta till kromosom 8q23 – q24

Abstrakt Kronisk idiopatisk tarm-pseudobstruktion (CIIP) är ett sällsynt och allvarligt kliniskt syndrom som kännetecknas av symtom och tecken på tarmens ocklusion, i frånvaro av mekanisk hindring av tarmen. I försöket att identifiera den genetiska grunden för CIIP analyserade vi en turkisk stamtavla med en hög grad av konsanguinitet där tre syskon presenterade en syndromisk form av CIIP. Alla dra

Ett familjär fall av alveolär kapillär dysplasi med felinställning av lungår stöder faderlig avtryck av FOXF1 hos människor

Ett familjär fall av alveolär kapillär dysplasi med felinställning av lungår stöder faderlig avtryck av FOXF1 hos människor

ämnen imprinting Andningsvägssjukdomar Abstrakt Alveolär kapillär dysplasi med felinställning av pulmonala vener (ACD / MPV) är en sällsynt utvecklingslösningssjukdom som är enhetligt dödlig. Påverkade barn dör inom de första veckorna av sitt liv trots aggressiv behandling, även om några få fall av sen manifestation och längre överlevnad har rapporterats. Vi har tidigare

Desbuquois dysplasi typ I och fetala hydrops på grund av nya mutationer i CANT1-genen

Desbuquois dysplasi typ I och fetala hydrops på grund av nya mutationer i CANT1-genen

ämnen Sjukdomgenetik Genotyping och haplotyping Mutation Abstrakt Vi rapporterar om tre hydropiska foster på 17, 22 och 25 graviditetsveckor från tre distinkta familjer med Desbuquois dysplasi typ 1. Alla fostrar visade brachymelia och karakteristiska dysmorfiska funktioner. Röntgenstudier avslöjade 5- formade extrafalangeala ben och sjukdomsspecifik framträdande hos den mindre trochanter, varierande i svårighetsgrad med fosteråldern. Tidig

Variabel avtryckning av MEST-genen i humana preimplantationsembryon

Variabel avtryckning av MEST-genen i humana preimplantationsembryon

ämnen Genetisk predisposition för sjukdom imprinting Infertilitet Fortplantningstekniker Abstrakt Det finns bevis för att expression och metylering av den intryckta paternalt uttryckta gen 1 / mesoderm-specifika transkriptionshomologen ( PEG1 / MEST ) -gen kan påverkas av assisterad reproduktionsteknologi (ART) och infertilitet. I

Gen-miljöinteraktioner för komplexa egenskaper: definitioner, metodkrav och utmaningar

Gen-miljöinteraktioner för komplexa egenskaper: definitioner, metodkrav och utmaningar

Abstrakt Genetiska och miljömässiga riskfaktorer och deras interaktioner bidrar till utvecklingen av komplexa sjukdomar. I denna översikt diskuterar vi metodologiska problem som är involverade i undersökning av gen-miljö (G × E) -interaktioner i genetisk-epidemiologiska studier av komplexa sjukdomar och deras potentiella relevans för klinisk tillämpning. Även om

Intravitreal leverans av AAV-NDI1 ger funktionell fördel i en murin modell av Leber ärftlig optisk neuropati

Intravitreal leverans av AAV-NDI1 ger funktionell fördel i en murin modell av Leber ärftlig optisk neuropati

ämnen Genterapi Mitokondrialt genom Mutation Neurodegenerativa sjukdomar Abstrakt Leber ärftlig optisk neuropati (LHON) är en mitokondriellt ärftlig form av visuell dysfunktion orsakad av mutationer i flera gener som kodar underenheter i mitokondriell respiratorisk NADH-ubikinonoxidoreduktaskomplex (komplex I). Ut

En mutation i ett alternativt otranslaterat exon av hexokinas 1 associerat med ärftlig motor och sensorisk neuropati - Russe (HMSNR)

En mutation i ett alternativt otranslaterat exon av hexokinas 1 associerat med ärftlig motor och sensorisk neuropati - Russe (HMSNR)

Abstrakt Hereditary Motor and Sensory Neuropathy - Russe (HMSNR) är en allvarlig autosomal recessiv störning, identifierad i zigenarepopulationen. Våra tidigare studier kartlade genen till 10q22-q23 och förfinade genregionen till ∼ 70 kb. Här rapporterar vi den omfattande sekvenseringsanalysen och fin kartläggning av denna region, vilket reducerar den till ∼ 26 kb av fullständigt karaktäriserad sekvens som sträcker sig över uppströms exonerna av Hexokinase 1 ( HK1) . Vi identifier

Utöka det kliniska spektrumet för de 16p11.2 kromosomala omarrangemangen: tre patienter med syringomyelia

Utöka det kliniska spektrumet för de 16p11.2 kromosomala omarrangemangen: tre patienter med syringomyelia

ämnen Kromosomavvikelse Genetisk variation patogenes Ryggmärgssjukdomar Abstrakt 16p11.2 omarrangemang är förknippade med utvecklingsfördröjning, kognitiv försämring, autismspektrumstörning, beteendeproblem (speciellt uppmärksamhetsunderskott hyperaktivitetsstörning), kramper, fetma, dysmorfa funktioner och onormal huvudstorlek. Dessutom

En genomomfattande föreningsstudie identifierar PLCL2 och AP3D1-DOT1L-SF3A2 som nya känslighetslokaler för hjärtinfarkt på japanska

En genomomfattande föreningsstudie identifierar PLCL2 och AP3D1-DOT1L-SF3A2 som nya känslighetslokaler för hjärtinfarkt på japanska

ämnen Genomfattande föreningsstudier Abstrakt Trots betydande framsteg i förebyggande och terapeutiska strategier är hjärtinfarkt (MI) en av de ledande dödsorsakerna i hela världen. Totalt har 55 känslighetsgener identifierats mestadels i europeiska genomomfattande föreningsstudier (GWAS). Icke desto mindre kan storskaliga GWAS från andra befolkningar möjligen hitta ytterligare känslighetsplatser. För att id

Föreningsstudie med flera etniska genom omfattar identifierar nya platser för typ 2-diabetes mottaglighet

Föreningsstudie med flera etniska genom omfattar identifierar nya platser för typ 2-diabetes mottaglighet

ämnen Genetisk variation Genomfattande föreningsstudier Abstrakt Genomfattande föreningsstudier (GWAS) har traditionellt genomförts i homogena populationer från samma släktgrupp. Med den ökande tillgängligheten av GWAS i storskaliga multietniska kohorter har vi emellertid utvärderat en ram för att upptäcka associering av genetiska varianter med komplexa egenskaper, möjliggöra befolkningsstruktur, och utvecklat ett kraftfullt test av heterogenitet i alleliska effekter mellan förfädergrupper . Vi har använt

Klinisk nyttekort för: Centronukleära och myotubulära myopatier

Klinisk nyttekort för: Centronukleära och myotubulära myopatier

ämnen Diagnos Genetisk testning Neuromuskulär sjukdom 1. Sjukdomskarakteristika 1.1 Sjukdomens namn (synonymer) Centronukleär myopati, myotubular myopati. 1 1.2 OMIM # av sjukdomen Myotubular myopati, XLCNM, MTM, XLMTM, CNMX, X-länkad recessiv centronukleär myopati, 310400 Centronuclear myopathy 1, CNM1, autosomal dominant, 160150 Centronukleär myopati 2, CNM2, autosomal recessiv, 255200 1.3 Nam

Sök efter förändringar av kopienummer i MEFV-genen med multiplex-ligationssondamplifiering, erfarenhet från tre diagnostiska centra

Sök efter förändringar av kopienummer i MEFV-genen med multiplex-ligationssondamplifiering, erfarenhet från tre diagnostiska centra

Abstrakt Familial medelhavsfeber (FMF) är en ärftlig autoinflammatorisk autosomal recessiv sjukdom orsakad av mutationer i MEFV- genen. Trots identifiering av många sjukdomsassocierade MEFV- mutationer kan ofta den kliniska diagnosen inte genetiskt bekräftas. De för närvarande använda diagnostiska sekvenseringsteknikerna tillåter endast detektering av punktmutationer, små borttagningar eller duplikationer. Frågan

Behandling av muskulära atrofi-celler med läkemedel som uppreglerar SMN-uttryck avslöjar variation mellan patienter och patienter

Behandling av muskulära atrofi-celler med läkemedel som uppreglerar SMN-uttryck avslöjar variation mellan patienter och patienter

ämnen Drogterapi Genreglering Motorisk neuronsjukdom Mutation Abstrakt Spinal muskulär atrofi (SMA) är en genetisk neuromuskulär störning orsakad av mutationer i SMN1- genen. Den homologa kopian ( SMN2 ) finns alltid i SMA-patienter. SMN1-genutskrifter är vanligtvis i full längd (FL), men exon 7 delas ut i en hög andel SMN2- transkript (delta7) (Δ7). Framste

Mindre och större borttagningar av Williams Beuren-syndromregionen innebär gener som är involverade i mild ansiktsfenotyp, epilepsi och autistiska egenskaper

Mindre och större borttagningar av Williams Beuren-syndromregionen innebär gener som är involverade i mild ansiktsfenotyp, epilepsi och autistiska egenskaper

ämnen Sjukdomgenetik Nevroutvecklingsstörningar Abstrakt Williams Beuren syndrom (WBS) är en multisystemisk störning orsakad av en hemizygot borttagning av 1, 5 Mb på kromosom 7q11.23 som sträcker sig över 28 gener. Några patienter med större och mindre WBS-deletion har rapporterats. De visar kliniska funktioner som varierar mellan isolerat SVAS till hela spektrumet av WBS-fenotyp, förknippat med epilepsi eller autismspektrumbeteende. Här besk

Aktiviteter och initiativ från det förnyade European Society of Human Genetics (ESHG) (1992–2017)

Aktiviteter och initiativ från det förnyade European Society of Human Genetics (ESHG) (1992–2017)

ämnen Utbildning Medicinsk genetik Publiceringsegenskaper Den här korta inledande anmärkningen är en fortsättning på den artikel som redan publicerades i tidskriften Special Edition av maj 2017. 1 Samfundets nya struktur och den drivkraft som detta skapade resulterade snart i ett antal initiativ utöver kärnaktiviteten på den årliga kongressen. Endast e

Genetisk testning och rådgivning i Europa: hälso- och sjukvårdspersonal aktuella utbildningsanordningar, behovsbedömning och potentiella strategier för framtiden

Genetisk testning och rådgivning i Europa: hälso- och sjukvårdspersonal aktuella utbildningsanordningar, behovsbedömning och potentiella strategier för framtiden

Genomikens vetenskap blir allt viktigare för vården i Europa. Uppskattningsvis 30 miljoner människor lider nu av genetiska sjukdomar inom det utvidgade europeiska samfundet. 1 Allt fler patienter begär genetisk testning och genetisk rådgivning. 2 Ett viktigt element för att förbättra kvaliteten på genetiska testtjänster i Europa är tillhandahållandet av lämplig genetisk utbildning för hälso- och sjukvårdspersonal. Detta har visa

Kliniskt nyttekort för: Arteriellt tortuositetssyndrom

Kliniskt nyttekort för: Arteriellt tortuositetssyndrom

ämnen Aortasjukdomar 1. SYKDOMSEGENSKAPER 1.1 Sjukdomens namn (synonymer) Arteriellt tortuositetssyndrom (arteriellt tortuositet). 1.2 OMIM # av sjukdomen 208.050. 1.3 Namn på de analyserade generna eller DNA / kromosomsegmenten SLC2A10 , även kallad GLUT10 , beläget i kromosomalt segment 20q13.12. 1.

Strukturell variation i Xq28: MECP2-duplikationer hos 1% av patienterna med oförklarlig XLMR och hos 2% av manliga patienter med svår encefalopati

Strukturell variation i Xq28: MECP2-duplikationer hos 1% av patienterna med oförklarlig XLMR och hos 2% av manliga patienter med svår encefalopati

En rättelse till denna artikel publicerades den 23 april 2009 Abstrakt Duplikationer i Xq28 som involverar MECP2 har beskrivits hos patienter med svår psykisk retardering, infantil hypotoni, progressiv spasticitet och återkommande infektioner. Det är dock ännu inte klart i vilken utsträckning dessa och tillhörande symtom kan variera. Dessu