Kemisk biologi (December 2019)

Allosterisk hämning av hypoxiinducerbar faktor-2 med små molekyler

Allosterisk hämning av hypoxiinducerbar faktor-2 med små molekyler

ämnen Biokemi Biofysik cancer Kemiska verktyg Screening med hög kapacitet Små molekyler Abstrakt Hypoxiainducerbara faktorer (HIF) är heterodimera transkriptionsfaktorer inducerade i många cancerformer där de ofta främjar uttrycket av protumorigena vägar. Även om transkriptionsfaktorer vanligtvis betraktas som "icke-brytbara", innehåller PAS-B-domänen i HIF-2a-underenheten ett stort hålrum inom dess hydrofoba kärna som erbjuder ett unikt fotfäste för små molekylregleringar. Här identifier

Chiral cykloaddition

Chiral cykloaddition

ämnen Reaktionsmekanismer Kemisk syntes Angew. Chem. Int. Ed. 51 , 1248–1251 (2012) Domino-reaktioner erbjuder enkel tillgång till komplexa molekylära arkitekturer, ofta med utsökt stereokemisk kontroll. Shi et al . ge ett elegant exempel på detta tillvägagångssätt i en ny [2 + 2 + 2] cykloaddition-reaktion som kombinerar Michael och Henry-reaktioner för att få tillgång till en cyklohexanprodukt med stereokemiskt definierade substituenter vid varje ringkol. I synnerhet

Inteins under wraps

Inteins under wraps

ämnen DNA-skada och reparation Enzymmekanismer Modifieringar efter översättningen Förutsägelser om proteinstruktur Nucleic Acids Res. doi: 10, 1093 / nar / gkv612 Inteiner är självskarvande element som skär sig från översatta proteiner för att lämna efter extein, eller moget protein. Majoriteten av funktionellt relevanta rester tros vara interna i inteinet, även om några få rester i extein-sekvensen som direkt gränsar till inteinet har visat sig påverka funktion. Vissa inte är k

Minsta information om ett biosyntetiskt genkluster

Minsta information om ett biosyntetiskt genkluster

ämnen Biosyntes Naturprodukter Sekvensanteckning Syntetisk biologi En mängd olika enzymatiska vägar som producerar specialiserade metaboliter i bakterier, svampar och växter är kända för att kodas i biosyntetiska genkluster. Information om dessa kluster, vägar och metaboliter sprids för närvarande i hela litteraturen, vilket gör det svårt att utnyttja. För att un

Mobilisering av peptider i immunitet

Mobilisering av peptider i immunitet

ämnen Immunologi peptider Att utnyttja immunsystemet för att behandla sjukdom underlättas genom en större förståelse för ursprung och roller hos peptider i immunitet. Det har varit känt i över 30 år att peptider är kritiska faktorer för att mobilisera immunsystemet mot främmande inkräktare. Sedan dess h

Erratum: Aminoglykosidaktivitet observerades på enstaka pre-translokation ribosomkomplex

Erratum: Aminoglykosidaktivitet observerades på enstaka pre-translokation ribosomkomplex

ämnen Handlingsmekanism ribosomen Strukturell biologi tRNA-sekvenser Den ursprungliga artikeln publicerades den 29 november 2009 Nat. Chem. Biol. 6 , 54–62 (2010); publicerad online 29 november 2009; korrigerat efter tryck 12 februari 2010 I den version av denna artikel som ursprungligen publicerades, i nyckeln för figur 6a, var enheterna för två av hämmarkoncentrationerna felaktigt märkta som "M", där de borde ha läst "μM". Felet har

Erratum: Insikter i mukopolysackaridos I från strukturen och verkan av a-L -iduronidas

Erratum: Insikter i mukopolysackaridos I från strukturen och verkan av a-L -iduronidas

ämnen Kemisk biologi Metaboliska störningar Strukturell biologi Den ursprungliga artikeln publicerades den 11 september 2013 Nat. Chem. Biol. ; doi: 10, 1038 / nchembio.1357; korrigerade online 20 september 2013 I den version av denna artikel som ursprungligen publicerades online, i metodavsnittet "Syntetiserade IDUA-hämmare", tillhandahölls två olika kemiska namn för 5F-IdoAF, och ett komplett namn för 2F-IdoAF utelades oavsiktligt. I för

Rättelse: Molekylär avbildning av väteperoxid producerad för cellsignalering

Rättelse: Molekylär avbildning av väteperoxid producerad för cellsignalering

Den ursprungliga artikeln publicerades den 1 april 2007 Nature Chemical Biology 3 , 263–267 (2007); publicerad online 1 april 2007; korrigerad efter tryck 3 maj 2007 I den version av denna artikel som ursprungligen publicerades är den andra författarens efternamn felstavad. Författarens namn bör läsa Orapim Tulyathan. Felet

Rättelse: Liten molekylbaserad reversibel omprogrammering av cellulär livslängd

Rättelse: Liten molekylbaserad reversibel omprogrammering av cellulär livslängd

Nature Chemical Biology 2 , 369–374 (2006); publicerad online 11 juni 2006; korrigerad efter tryck 22 december 2006 I den version av denna artikel som ursprungligen publicerades förklarades inga konkurrerande ekonomiska intressen. Författarna förklarar nu att de har konkurrerande intressen som kan uppfattas för att påverka de resultat och diskussioner som rapporteras i denna artikel, vilka är detaljerade i en förklaring om konkurrerande ekonomiska intressen som följer med artikeln. Felet ha

Rättelse: SMN2-skarvmodulatorer förbättrar U1-före-mRNA-förening och räddar SMA-möss

Rättelse: SMN2-skarvmodulatorer förbättrar U1-före-mRNA-förening och räddar SMA-möss

Den ursprungliga artikeln publicerades den 1 juni 2015 Nat. Chem. Biol. 11 , 511–517 (2015); publicerad online 1 juni 2015; korrigerade online 15 juli 2015 Författarna glömde att inkludera en beskrivning av mätningen av SMN-proteinnivåer i vävnadsprover i onlinemetoderna. Denna beskrivning har inkluderats i HTML- och PDF-versionerna av artikeln. Förfa

I detta nummer

I detta nummer

En rättelse till denna artikel publicerades den 1 mars 2009 Den här artikeln har uppdaterats Compound screening blir mer specifik Flödescytometri är ett användbart verktyg för helcellscreening genom att flera proteiner i flera celltyper kan övervakas i ett enda experiment eller i en inställning med hög kapacitet. Krutzik

Fånga samarbete

Fånga samarbete

Att överväga vanliga definitioner och mekanismer för kooperativt beteende kan leda till ny insikt om kemisk och biologisk funktion. Kooperativitet är välkänt som den energiska basen för en mängd mikroskopiska händelser, såsom samtidig kelering av metalljoner, den temporära koordinationen av proteinvikning och den samordnade funktionen av biomolekylära enheter. I makroska

En vindkraft för RNA

En vindkraft för RNA

Två Nobelpriser 2006 återspeglar RNA: s centrala roll i genreglering och betonar samspelet mellan upptäckter inom kemi och biologi. RNA har varit framträdande i en serie nyligen banbrytande upptäckter. I december 2006 erkände Nobelkommittén två sådana framsteg genom att tilldela Nobelpriset i kemi till Roger Kornberg för sitt arbete med att belysa molekylmekanismerna för RNA-transkription och Nobelpriset i fysiologi eller medicin till Craig Mello och Andrew Fire för deras upptäckt av RNA-interferens (RNAi). I anledning

Rättelse: Dynamik kopplar substratigenkänning till katalys i proteinkinas A

Rättelse: Dynamik kopplar substratigenkänning till katalys i proteinkinas A

ämnen Enzymmekanismer kinaser Molekylär konformation Den ursprungliga artikeln publicerades den 3 oktober 2010 Nat. Chem. Biol. 6 , 821–828 (2010); publicerad online 3 oktober 2010; korrigerat efter tryck 18 april 2011 I den version av denna artikel som ursprungligen publicerades erkände författarna felaktigt finansiering från US National Institutes of Health, GM64742. Rätt

Tvingande kommentarer

Tvingande kommentarer

ämnen Kemisk biologi publicering Forskare måste vara uppmärksamma för att säkerställa integriteten i den publicerade posten och hitta nya sätt att underlätta vetenskaplig debatt i den elektroniska tidsåldern. I vår tid med aktuell rapportering och sociala nätverk, nyligen publicerade vetenskapliga upptäckter - särskilt de som visas i högprofilerade tidskrifter - når större vetenskapliga publik och allmänheten med större effektivitet. Men dessa online

Erratum: Endoplasmatisk retikulum Ca2 + ökar förbättrad mutant glukocerebrosidas-proteostas

Erratum: Endoplasmatisk retikulum Ca2 + ökar förbättrad mutant glukocerebrosidas-proteostas

ämnen Kalciumsignalering Endoplasmatiska retiklet Metaboliska sjukdomar Den ursprungliga artikeln publicerades den 9 maj 2010 Nat. Chem. Biol. 6 , 424–432 (2010); publicerad online 9 maj 2010; korrigerad efter tryck 21 maj 2010. I versionen av denna artikel som ursprungligen publicerades gav en av de använda cellinjerna felaktigt mutantbeteckningen L444P med hänvisning till figur 6a, och en annan cellinje inkluderade inte denna beteckning med hänvisning till kompletterande figur 11a, b. Fele

Vidöppna ögon

Vidöppna ögon

Att förstå hur proteiner fungerar isolerat och i sitt ursprungliga sammanhang kräver en sammanslagning av molekylnivåstekniker som utforskar samspelet mellan proteinstruktur och dynamik. Begreppen "en gen, ett enzym" och "struktur bestämmer funktion" är grundläggande principer för modern biokemi. Lägg t

Rättelse: Bekämpa neurodegenerativ sjukdom med kemiska sonder och modellsystem

Rättelse: Bekämpa neurodegenerativ sjukdom med kemiska sonder och modellsystem

ämnen Biologiska modeller Kemisk biologi Neurodegenerativa sjukdomar Therapeutics Nat. Chem. Biol. 10 , 911–920 (2014); publicerad online 17 oktober 2014; korrigerat efter tryck 11 december 2014 I den version av detta papper som ursprungligen publicerades märktes "fas" -posten för PBT2 i tabell 1 oavsiktligt som "Avbruten". Det

Förminska de verkliga målen

Förminska de verkliga målen

ämnen Kemisk genetik proteomik Målidentifiering Många kinashämmare för cancerterapi är ganska icke-selektiva och deras cellulära verkningsmekanismer är ofullständigt förstått. En kapslad kemisk proteomik och kemisk genetikstrategi avslöjar vilka cellulära mål för den kliniska kinasinhibitorn dasatinib som funktionellt relaterar till dess anti-onkogena aktivitet. Deregulerad s

Sätta data i arbete

Sätta data i arbete

ämnen databaser Genomics Vetenskapligt samhälle Optimal användning av de omfattande datamängder som genereras under den post-genomiska eran kommer att kräva tydliga standarder och ett åtagande för öppen kommunikation. Kemister och biologer har traditionellt avancerad vetenskap genom att definiera ett särskilt intressesystem, formulera modeller för hur systemet fungerar och testa dessa modeller i ökande nivåer av molekylär upplösning. Ankomsten av